ERROR: dependency ‘XML’ is not a

在做RNA-SEQ时候，用hisat2，stringtie，ballgown流程，在过程中需要'genefilter','dplyr','devtools','ballgown'四个R包，'dplyr','devtools'安装的很成功，但是genefilter和ballgown总是有错， 

我的系统是64bit Mac OS X 10.14.3（黑苹果）,R的版本是3.5.2。

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")

biocLite(c('genefilter','dplyr','devtools','ballgown'))

install .pacakges('XML')也无果。

总之就是XML这个装的有问题，网上找了很久无果。去CRAN查找<a href="https://cran.r-project.org/web/packages/XML/index.html">XML</a>.

下载os二进制版本r-release，为tar压缩文件，在同目录打开R命令行，

install.packages("XML_3.98-1.20.tgz", repos=NULL)

又出现问题

这次倒是很明显，就是XML包版本太高了，换老版本。

这次很成功，包括genefilter和ballgown安装都很成功。

安装成功

总结：这是R语言的包的安装方法的一种。