软件安装
miniconda安装
wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-4.5.11-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-4.5.11-Linux-x86_64.sh
配置镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
image.png
查看当前conda环境
conda info --envs
image.png
激活/进入conda的rna环境，避免每次用-n rna
source activate rna
image.png
安装 sra-tools软件
conda search sra-tools
conda install -y sra-tools
image.png
image.png
image.png
出现3个done为成功
数据下载
解读SRA数据库规律一文就够
https://mp.weixin.qq.com/s/1BTerwyy1vD425bFMPc6RQ
可以更改SRR号的ncbi
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study/?acc=SRR1039508&go=go
我不会下载，别人下载好的数据，我链接过来的
image.png
不知道为什么我一直下不下来
SRA转fq文件时的报错
image.png
最后一个转成功的，没有报错
image.png
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