单细胞染色质开放区域测序技术被NIH的kejizhao承包了

最近听了南科大靳文菲老师演讲，其中一页PPT提到了他发表在Nature. 2015 Dec 的文章：Genome-wide detection of DNase I hypersensitive sites in single cells and FFPE tissue samples.就是单细胞染色质开放区域测序技术，我比较感兴趣就搜索了一下发现了一个很有趣的事实

单细胞染色质开放区域测序技术被NIH的kejizhao承包了!

• 首先NIH的kejizhao在25 November 2015 发表在nature杂志的文章：Genome-wide detection of DNase I hypersensitive sites in single cells and FFPE tissue samples

• 然后是NIH的kejizhao发表在Nat Protoc. 2017 Nov 的文章Genome-wide mapping of DNase I hypersensitive sites in rare cell populations using single-cell DNase sequencing.

• 然后是NIH的kejizhao发表在Nature. 2018 Oct 的文章Principles of nucleosome organization revealed by single-cell micrococcal nuclease sequencing. 数据在：GSE96688

• 昨天是NIH的kejizhao发表Nat Protoc， December 2019 ，文章是：Genome-wide profiling of nucleosome position and chromatin accessibility in single cells using scMNase-seq

关于NIH的kejizhao我将委托一位朋友写一下他的故事

在基因组中，大部分的染色质紧密缠绕在细胞核内，不具有转录活性。染色质重塑作用可以使部分致密的染色质变得松散，这部分松散的染色质被称为开放染色质（open chromatin）或可接近性染色质（accessible chromatin）。

对开放染色质的测序主要有以下几种方法：

1. DNase-seq
2. MNase-seq
3. ATAC-seq
4. ChIP-seq
5. FAIRE-seq