1: samtools faidx test.fa 生成文件test.fa.idx，然后cut -f1,2 faidx
2：pip install pyfaidx ，然后faidx -i chromsizes test.fa
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基因组长度 利用seqkit统计长度 结果如下： sum_len总长度 各条染色体 利用pyfaidx 或者利用s...
题目来自生信技能树论坛 统计人类参考基因组的每条染色体长度，每条染色体N的含量，GC含量因为我下载的是hg38,所...
1: samtools faidx test.fa 生成文件test.fa.idx，然后cut -f1,2 fai...
在这个例子中，主要的目标是评估基因组组装后的信息，包括染色体的总长度、染色体的数目、染色体的平均长度、最长的染色体...
我们在做基因组或者转录组数据分析的时候，经常需要用到染色体的长度。今天我们就来聊聊如何获取染色体的长度。我们以人的...
做完基因组注释后需要统计一下基因长度，CDS长度和intron以及exon长度。 1.首先统计基因数目，直接使用l...
基因组信息统计，首先是对基本信息的统计，这些基本信息包括一个基因组的N50、N90、每个染色体或者scaffold...
karyoploteR 1、安装 2、绘图 （1）画基因组 （2）在染色体上映射标记 再画好基因组/染色体...
实战演练
导读 将二代三代Unicycler混合组装结果进行整理：抽提染色体/质粒序列，统计GC含量，统计序列长度，结构。 ...
本文标题：统计基因组染色体长度
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/pwddrrtx.html
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