1、Data Transfer Tool准备
TCGA官网/GDC Apps/Data Transfer Tool/Getting Started/Data Transfer Tool page
Data Transfer Tool下载(1).png
Data Transfer Tool下载(2).png
Data Transfer Tool下载(3).png
Data Transfer Tool下载(4)解压缩前后.png
2、准备manifest文件
- 以TCGA-CHOL RNA-Seq为例,下图所示
image.png manifest文件下载(1).png步骤 1):bing(GDC TCGA)
步骤 2):TCGA-CHOL
manifest文件下载(2).png
manifest文件下载(3).png
manifest文件下载(4).png
manifest文件下载(5).png
manifest文件下载(6).png
插播:如果下载的RNAseq文件小于50m,可以直接点击12cart下载
manifest文件下载(7).png
注释:先需要知道上面的manifest文件放在哪个盘,这里是D盘。并且将下载好的并解压后的Data Transfer Tool(gdc-client.exe)和manifest文件放在同一个文件夹下。
3、打开命令提示符
1.png1)打开DOS
1
- 切换到文件夹的盘,即D盘(D:+enter)
2
3)转到目的文件夹下面()
3
4)下载命令(gdc-client.exe download -m gdc_manifest_20200216_120520.txt)
4
5)开始下载
5
6)压缩包的形式
6
1、借鉴来源(文字和视频)
2、借鉴来源
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