安装
conda install seqkit
使用
seqkit fx2tab --length --name --header-line test.fasta
结果展示
#name length
ctg000040 434431
ctg000000 569669
ctg000200 69261
ctg000010 851976
ctg000120 1205806
ctg000090 1384500
使用Python对fasta格式的序列进行基本信息统计预期设计输出文件中包括fasta文件名，序列长度，GC含量以...
seqkit 安装 使用 结果展示
计算FASTA文件中每条序列的长度输入文件fasta.txt 脚本如下，脚本名：get_fasta.pl 运行脚本...
1、grep文件内搜索 （支持正则表达式） （1）统计 fasta 文件中序列条数grep ">" a.fasta...
1.序列长度分布统计 2.FASTQ转换成FASTA 3.统计各种碱基个数及GC%
计算FASTA文件中每条序列的长度输入文件fasta.txt 自己写脚本 网上其他答案 自己写的还是会有欠缺，没有...
参考 https://www.cnblogs.com/xudongliang/p/5200655.html 使用命...
首先得到每条序列的长度，在这里使用seqkit软件。seqkit软件是一个强大的序列处理工具，安装方法参见官方网站...
组装结果统计 下面对组装得到fasta 格式基因组序列进行长度、N50 等统计。 使用assembly-stats...
fasta文件格式：fasta 文件为一个 ID 对应一个 序列,可以是 转录本序列, 蛋白序列 ''' V350...
本文标题：FASTA文件统计序列长度
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/qaleqdtx.html
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