FASTA文件统计序列长度

seqkit

安装

conda install seqkit

使用

seqkit fx2tab --length --name --header-line  test.fasta

结果展示

#name   length
ctg000040        434431
ctg000000        569669
ctg000200        69261
ctg000010        851976
ctg000120        1205806
ctg000090        1384500