一个从未被善待的天才，心中没有善与恶，只有对香味的纯粹热爱。这是一个荒诞、离奇却又有些惊悚的故事。
他出生在一个臭气熏天的鱼市，刚生下来就被母亲扔在了堆满污浊的垃圾堆里，连看都不看一眼。他用鼻子嗅着这肮脏的世界，并用一声啼哭把他的母亲送上了绞刑架。
跟他接触的每一个人，都只是想利用他，没有人曾真正在意过他。孤儿院想从他身上挣到养育金，制革师傅把他当做牲口使用，不过这些他都不在乎，他只想活着，只想能有机会多收集一些这世上的气味。
在此期间，他已经收集了成千上万种气味，不论好的坏的，从一颗小草、一滴水到一个人、一条街道，所有的气味他都统统收集，存入他的气味宫殿。
偶然的一天，他被一种特别的香味吸引，那是一位美丽的少女身上散发出来的。他跟着这香味寻找，在少女的背后仔细地嗅着。后来少女发现了他，情急之下，他将少女勒死了。然后，他趴在少女身上，贪婪的嗅着她的肌肤、她的头发，可是这气味却渐渐消散不见，少女的身体已经没有了温度。他感到一阵绝望，他想要找到保存这香味的方法。
后来他遇到了一个落魄的香水专家，由此，他的天才得到充分的发展。香水专家利用他的嗅觉天赋，赚取了不菲的财富，而在他离开时，却只得到了一个背包和极少的路费。但他不在乎，因为他现在已经自由了，他在香水专家这里已经没有任何可以学到的东西了，他将去往南方的香水圣地，学习更加高级的芳香萃取技术。
在前往南方香水圣地的路上，他感到的自由与舒畅，他远离了人群，选择了荒僻的小路，尽情享受着自然的纯粹气味。后来，他找到了一个坑洞，那里没有任何气味，他在这里将所有的污浊气味释放，感到从未有过的轻松。可是，他在这里发现自己原来是没有任何气味的，他仿佛在这个世界就不存在，恐惧向他袭来。这时，他回忆起少女身上的迷人芳香，他决定要用自己的天才，将这香味占为己有，这将是他活下去的动力。
他来到了香水圣地，在这里学习了更高级的芳香萃取技术，并开始了他惊悚的气味狩猎。他不断地寻找气味迷人的少女，提取她们身上的香味。一旦她们有一丝恐惧，香味就会变坏，所以他用棒子悄无声息地将她们杀死，然后进行香味的提取。
接连的惨案，让整个城市的人陷入了恐慌，人们开始处处提防，互相猜忌，日夜不得安宁。在他提取到26个少女的香味时，他被捕了，将被酷刑处死。
就在行刑的那天，吸引了数万人来观看，人们想要一睹这恶魔的真面目，想要亲眼看着他怎么被折磨至死。可是人们不知道，他的计划已经完成，他从想制作的——让任何人都仰慕他都喜欢他的香水已经制作完成。当他出现的时候，仿佛一个天使，所有人都为之疯狂。
人们被他身上香水的气味陶醉了，陷入了深深的情欲之中，老人和少妇，修女与教士，不分年龄与身份，人们脱光了衣服纵情声色……
他看着此刻这些疯狂的人们，心中只有蔑视与憎恨，觉得一切都索然无味。他带着他的香水离开了，回到了自己出生的地方，将整瓶香水倒在了自己的头上，任凭那些强盗流浪汉将自己生吞活剥，吃得一点都不剩……
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