这是三种ShuffleWriter
中最通用的情况,对应BaseShuffleHandle
,此时可以在map端进行数据合并,否则不向排序工具ExternalSorter
传入排序相关参数,只会根据key值获取对应的分区id,来划分数据,不会在分区内排序,如果结果需要排序,例如sortByKey
,会在reduce端获取shuffle数据后进行
override def write(records: Iterator[Product2[K, V]]): Unit = {
//根据是否在map端进行数据合并初始化ExternalSorter
sorter = if (dep.mapSideCombine) {
require(dep.aggregator.isDefined, "Map-side combine without Aggregator specified!")
new ExternalSorter[K, V, C](
context, dep.aggregator, Some(dep.partitioner), dep.keyOrdering, dep.serializer)
} else {
// 不进行聚合,就不进行排序,如果有需要reduce端再进行排序
new ExternalSorter[K, V, V](
context, aggregator = None, Some(dep.partitioner), ordering = None, dep.serializer)
}
sorter.insertAll(records)
// shuffle输出文件
val output = shuffleBlockResolver.getDataFile(dep.shuffleId, mapId)
val tmp = Utils.tempFileWith(output)
try {
val blockId = ShuffleBlockId(dep.shuffleId, mapId, IndexShuffleBlockResolver.NOOP_REDUCE_ID)
//sorter中的数据写出到该文件中
val partitionLengths = sorter.writePartitionedFile(blockId, tmp)
// 写出对应的index文件,纪录每个Partition对应的偏移量
shuffleBlockResolver.writeIndexFileAndCommit(dep.shuffleId, mapId, partitionLengths, tmp)
//shuffleWriter的返回结果
mapStatus = MapStatus(blockManager.shuffleServerId, partitionLengths)
} finally {
if (tmp.exists() && !tmp.delete()) {
logError(s"Error while deleting temp file ${tmp.getAbsolutePath}")
}
}
}
ExternalSorter[K, V, C]
继承关系
MemoryConsumer (org.apache.spark.memory)
Spillable (org.apache.spark.util.collection)
ExternalSorter (org.apache.spark.util.collection)
对[K,V]键值对数据排序,支持聚合,可以按照键值,转换为(K, C)类型的数据
首先将键值K根据分区器分配到相应的分区中,如果需要聚合数据,就对每个分区中的键值进行排序,否则,则类型C必须等于V,不会进行分区内部排序
参数:
- aggregator 聚合器 - 可选,用于合并数据
- partitioner 分区器 - 优先按分区id排序
- ordering 排序 - 可选,为每个分区内的键值排序
- serializer 序列化器 - 写出数据到磁盘时使用
只有在确实需要输出的K为有序的时候才提供Ordering。如果map端的ShuffleMapTask不需要合并,排序参数传递Null,以避免额外排序;另一方面,如果确实想要合并,有Ordering参数会更加高效,否则使用的hash值排序,然后hash值相同再判定key值本身是否相同进行合并
- 实例化一个ExternalSorter
- 用一组记录调用insertAll()
- 调用writePartitionedFile()写出一个文件,作为Shuffle输出,也支持调用iterator方法,返回排序合并过的所有元素
类在内部工作原理如下:
- 重复填充内存数据缓冲区,如果要按K组合,使用
PartitionedAppendOnlyMap
,否则使用PartitionedPairBuffer
。在这些缓冲区中,按分区ID对元素进行排序,然后也可能通过K值来排序。为避免每个K值多次调用分区器获取分区id,将分区ID与每条记录的K一起存储,作为实际的键值 - 当每个缓冲区达到内存限制时,会将其写出(spill)到一个文件中,这个文件内存会按分区id顺序写出,如果需要进行聚合,排序时会先比较id,相同时再按K值或K值的哈希码(没有传递K的比较器的时候)排序
- 当用户请求迭代器或文件输出时,溢出文件将以及剩余的内存数据合写成一个有序的文件。如果需要按K值进行聚合,可以使用排序参数决定顺序,或者先根据键值的哈希码排序,然后将相同hash的相互比较,如果相等就进行合并
- 最后调用
stop()
来删除所有中间文件
源码分析:
Aggregator
Aggregator内部包含三个函数,分别用来初始化C,合并V到C,合并C,在map端合并时会用到
case class Aggregator[K, V, C] (
createCombiner: V => C,
mergeValue: (C, V) => C,
mergeCombiners: (C, C) => C)
存储对象的数据结构
@volatile private var map = new PartitionedAppendOnlyMap[K, C]
@volatile private var buffer = new PartitionedPairBuffer[K, C]
PartitionedAppendOnlyMap
底层是一个AppendOnlyMap
类型的简单哈希表存储结构,特点是只会添加keys,不会删除key,数据存储在数组private var data = new Array[AnyRef](2 * capacity)
中,每对key和value连续存放,PartitionedAppendOnlyMap
对此进行了封装,它的键值是Tuple2类型的(Int, K),值是类型C,其中Int表示的是分区id,如果key值冲突,采用线性探测再散列处理冲突,同时混入了SizeTracker
特质,能够评估自身大致占用的内存数量
PartitionedPairBuffer
底层直接是一个数组存储数据,数据类型与PartitionedAppendOnlyMap
相同,将每条记录顺序插入即可,在不需要进行map端聚合的时候使用,也混入了SizeTracker
特质,用于评估自身大致占用的内存数量,其初始容量为64,即128长度的AnyRef
类型数组,实际相邻存储((partitionId, K), V)
比较函数
排序使用的是TimSort
,源自归并排序和插入排序
没有定义聚合使用WritablePartitionedPairCollection.partitionComparator
,只比较分区id
如果定义了排序,使用WritablePartitionedPairCollection.partitionKeyComparator
,先比较分区,后比较Key值
比较key值时,如果传入了自定义的Key值比较器,就是用该比较器进行Partition内部的比较,否则使用hash值比较,后续需要进行聚合时判断相同hash的key是否相同
// ExternalSorter 类
private val keyComparator: Comparator[K] = ordering.getOrElse(new Comparator[K] {
override def compare(a: K, b: K): Int = {
val h1 = if (a == null) 0 else a.hashCode()
val h2 = if (b == null) 0 else b.hashCode()
if (h1 < h2) -1 else if (h1 == h2) 0 else 1
}
})
private def comparator: Option[Comparator[K]] = {
if (ordering.isDefined || aggregator.isDefined) {
Some(keyComparator)
} else {
None
}
}
// WritablePartitionedPairCollection类,两种存储结构都混入了该伴生特质,如果Comparator[K]非空,先比较键值中的分区id,相等时比较实际的key
def partitionKeyComparator[K](keyComparator: Comparator[K]): Comparator[(Int, K)] = {
new Comparator[(Int, K)] {
override def compare(a: (Int, K), b: (Int, K)): Int = {
val partitionDiff = a._1 - b._1
if (partitionDiff != 0) {
partitionDiff
} else {
keyComparator.compare(a._2, b._2)
}
}
}
}
//只比较分区
def partitionComparator[K]: Comparator[(Int, K)] = new Comparator[(Int, K)] {
override def compare(a: (Int, K), b: (Int, K)): Int = {
a._1 - b._1
}
}
写入数据
具体调用:
def insertAll(records: Iterator[Product2[K, V]]): Unit = {
val shouldCombine = aggregator.isDefined
if (shouldCombine) {
// Combine values in-memory first using our AppendOnlyMap
// 定义update函数,根据不同情况,决定是合并V值到C中,还是创建一个新的C
val mergeValue = aggregator.get.mergeValue
val createCombiner = aggregator.get.createCombiner
var kv: Product2[K, V] = null
val update = (hadValue: Boolean, oldValue: C) => {
if (hadValue) mergeValue(oldValue, kv._2) else createCombiner(kv._2)
}
while (records.hasNext) {
//计数,元素数目加1
addElementsRead()
kv = records.next()
//写入数据
map.changeValue((getPartition(kv._1), kv._1), update)
//决定是否写出数据
maybeSpillCollection(usingMap = true)
}
} else {
// Stick values into our buffer
while (records.hasNext) {
addElementsRead()
val kv = records.next()
buffer.insert(getPartition(kv._1), kv._1, kv._2.asInstanceOf[C])
maybeSpillCollection(usingMap = false)
}
}
}
每次插入数据以后,都会调用maybeSpillCollection
判断是否需要将数据写入磁盘,内部会调用maybeSpill
,当底层存储的数据的集合内存不足申请内存时,通过spill(collection: C)
写出
spill写出
Spillable
是ExternalSorter
的父类,当前集合中的记录数目是elementsRead
,估计大小为currentMemory
,当集合中记录条数为32的整数倍,且估计大小大于内存阈值时,先尝试申请两倍内存大小的空间,如果成功增大阈值不进行落盘,如果内存不足时,则写出集合中的数据到磁盘中,内存阈值初始大小通过spark.shuffle.spill.initialMemoryThreshold
设定,初始为5MB
如果内存足够,即MemoryManager
始终能够提供足够大小的内存空间,一般就不需要落盘,除非达到了底层数组存储数目的上限
protected def maybeSpill(collection: C, currentMemory: Long): Boolean = {
var shouldSpill = false
// 集合中元素的数目为32的整数倍,且大于内存阈值时,判断是否需要写出
if (elementsRead % 32 == 0 && currentMemory >= myMemoryThreshold) {
// 内存扩容为当前两倍时需要额外的空间
val amountToRequest = 2 * currentMemory - myMemoryThreshold
// 确保有足够的空间,可以增加阈值,否则进行写出
val granted = acquireMemory(amountToRequest)
myMemoryThreshold += granted
shouldSpill = currentMemory >= myMemoryThreshold
}
// 元素数目大于阈值,强制写出,通过"spark.shuffle.spill.numElementsForceSpillThreshold"设定,默认是Long.MaxValue
shouldSpill = shouldSpill || _elementsRead > numElementsForceSpillThreshold
// 实际进行写出,调用ExternalSorter的spill方法
if (shouldSpill) {
_spillCount += 1
logSpillage(currentMemory)
spill(collection)
_elementsRead = 0
_memoryBytesSpilled += currentMemory
releaseMemory()
}
shouldSpill
}
private val spills = new ArrayBuffer[SpilledFile]
override protected[this] def spill(collection: WritablePartitionedPairCollection[K, C]): Unit = {
//传入比较器,对内存数据进行排序,返回一个排序后结果的迭代器
val inMemoryIterator = collection.destructiveSortedWritablePartitionedIterator(comparator)
//写出到文件
val spillFile = spillMemoryIteratorToDisk(inMemoryIterator)
spills += spillFile
}
写出函数spillMemoryIteratorToDisk
通过DiskBlockManager
获得一个文件,以及对应的DiskBlockObjectWriter
,缓存是32K,这里分批(batch,通过spark.shuffle.spill.batchSize
设定,默认10000纪录算一批)写出串行化后的数据,同时记录相关信息,封装返回,返回对象为SpilledFile(File, blockId, 每个batch写出的数据量大小 : Array[Long], 每个分区元素数目 : Array[Long])
最终写出数据
写出添加到ExternalSorter
的所有数据:
def writePartitionedFile(
blockId: BlockId,
outputFile: File): Array[Long] = {
// 纪录每个分区的数据长度
val lengths = new Array[Long](numPartitions)
val writer = blockManager.getDiskWriter(blockId, outputFile, serInstance, fileBufferSize,
context.taskMetrics().shuffleWriteMetrics)
if (spills.isEmpty) {
// 只有内存中的数据,没有溢出文件,那么顺序写出,记录每个分区大小即可
val collection = if (aggregator.isDefined) map else buffer
val it = collection.destructiveSortedWritablePartitionedIterator(comparator)
while (it.hasNext) {
val partitionId = it.nextPartition()
while (it.hasNext && it.nextPartition() == partitionId) {
it.writeNext(writer)
}
val segment = writer.commitAndGet()
lengths(partitionId) = segment.length
}
} else {
// 归并排序,把所有文件和当前内存中的数据合并,然后写出
// 读取时是按照partition顺序逐个处理,一个分区一个分区的合并
for ((id, elements) <- this.partitionedIterator) {
if (elements.hasNext) {
for (elem <- elements) {
writer.write(elem._1, elem._2)
}
val segment = writer.commitAndGet()
lengths(id) = segment.length
}
}
}
writer.close()
...
lengths
}
这里的核心是partitionedIterator
,将已排序的文件序列和内存中的数据合并,返回Iterator[(Int, Iterator[Product2[K, C]])]
迭代器,按分区分组,对每个分区,都有一个遍历其内容的迭代器,按顺序访问数据
private def merge(spills: Seq[SpilledFile], inMemory: Iterator[((Int, K), C)])
: Iterator[(Int, Iterator[Product2[K, C]])] = {
// 文件读取器
val readers = spills.map(new SpillReader(_))
val inMemBuffered = inMemory.buffered
//逐个分区处理
(0 until numPartitions).iterator.map { p =>
// 内存中的数据已经按照partition排序好了,所有可以通过迭代器顺序输出
val inMemIterator = new IteratorForPartition(p, inMemBuffered)
// 合并该分区ID下,文件数据迭代器和内存数据迭代器,类型为 Seq[Iterator[Product2[K, C]]]
val iterators = readers.map(_.readNextPartition()) ++ Seq(inMemIterator)
if (aggregator.isDefined) {
// key值相同进行聚合
(p, mergeWithAggregation(
iterators, aggregator.get.mergeCombiners, keyComparator, ordering.isDefined))
} else if (ordering.isDefined) {
// 没有聚合,但指定顺序的情况
(p, mergeSort(iterators, ordering.get))
} else {
(p, iterators.iterator.flatten)
}
}
}
-
mergeSort
:指定ordering
时,算法采用的是经典的将多个有序数据,合并为一个有序序列的算法,底层采用优先级队列,将多个迭代器作为元素,根据迭代器内的第一个元素作为大小比较的依据,读取时将元素最小的迭代器出队列,取出元素,再加入队列 - 什么都没有指定时,将
Seq[Iterator[Product2[K, C]]]
直接转换为Iterator[Product2[K, C]]
如果指定了聚合函数,实现细节:
- 如果指定了
ordering
时,采用mergeSort
,然后顺序读取时,key相同进行合并 - 如果没有指定顺序,依然采用
mergeSort
,不过是使用hash值进行比较的,读取时,将key的hash值相同的记录作为一批,同时读取处理,将key值实际相同的进行合并,最后顺序输出即可
private def mergeWithAggregation(
iterators: Seq[Iterator[Product2[K, C]]],
mergeCombiners: (C, C) => C,
comparator: Comparator[K],
totalOrder: Boolean)
: Iterator[Product2[K, C]] =
{
if (!totalOrder) {
// 没有提供自定义的排序方法,只是部分有序,使用hash值排序,
// 存在hash值相同,key值不同的情况
new Iterator[Iterator[Product2[K, C]]] {
//对此partition内的数据,根据K的hash值进行排序,底层是优先队列实现
val sorted = mergeSort(iterators, comparator).buffered
// Buffers reused across elements to decrease memory allocation
val keys = new ArrayBuffer[K]
val combiners = new ArrayBuffer[C]
override def hasNext: Boolean = sorted.hasNext
override def next(): Iterator[Product2[K, C]] = {
if (!hasNext) {
throw new NoSuchElementException
}
// 清空缓存
keys.clear()
combiners.clear()
// 获取第一个数据,不一定是sorter中的第一个数据
val firstPair = sorted.next()
// 添加到缓存
keys += firstPair._1
combiners += firstPair._2
val key = firstPair._1
// 获取下一个hash值相同的数据
while (sorted.hasNext && comparator.compare(sorted.head._1, key) == 0) {
// 当前数据
val pair = sorted.next()
var i = 0
var foundKey = false
// 遍历缓存,如果key值与当前数据相同,进行合并
while (i < keys.size && !foundKey) {
if (keys(i) == pair._1) {
combiners(i) = mergeCombiners(combiners(i), pair._2)
foundKey = true
}
i += 1
}
// 没有找到当前数据key值相同的记录,将当前记录添加到缓存
if (!foundKey) {
keys += pair._1
combiners += pair._2
}
}
//返回迭代器Iterator[Product2[K, C],他们key的hash值都相等
keys.iterator.zip(combiners.iterator)
}
}.flatMap(i => i)//把二次迭代展开
} else {
// 定义了ordering,先进行归并排序,然后key值相同的简单合并起来
new Iterator[Product2[K, C]] {
val sorted = mergeSort(iterators, comparator).buffered
override def hasNext: Boolean = sorted.hasNext
override def next(): Product2[K, C] = {
if (!hasNext) {
throw new NoSuchElementException
}
val elem = sorted.next()
val k = elem._1
var c = elem._2
while (sorted.hasNext && sorted.head._1 == k) {
val pair = sorted.next()
c = mergeCombiners(c, pair._2)
}
(k, c)
}
}
}
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