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R-拼图系列-ggplot2之patchwork

R-拼图系列-ggplot2之patchwork

作者: 小贝学生信 | 来源:发表于2021-11-08 21:20 被阅读0次

    相比R语言基础绘图函数,我更喜欢使用ggplot绘制的图形。而patchwork包是一个非常友好的,支持ggplot2对象拼图的工具包。操作简单,高效,nice~
    参考官方教程:https://patchwork.data-imaginist.com/index.html

    0、安装包以及绘制示例图

    # #install.packages("devtools")
    # devtools::install_github("thomasp85/patchwork")
    library(ggplot2)
    library(patchwork)
    
    p1 <- ggplot(mtcars) + geom_point(aes(mpg, disp))
    p2 <- ggplot(mtcars) + geom_boxplot(aes(gear, disp, group = gear))
    p3 <- ggplot(mtcars) + geom_bar(aes(gear)) + facet_wrap(~cyl)
    p4 <- ggplot(mtcars) + geom_bar(aes(carb))
    p5 <- ggplot(mtcars) + geom_violin(aes(cyl, mpg, group = cyl))
    

    1、直接拼图方法

    patchwork包提供有两种方式可供选择
    (1)符号连接:+或者| 均表示左右拼接,/表示上下拼接,()可以用于调整优先级
    (2)函数调用:wrap_plots()

    1.1 简单两张图

    p1 + p2   #左右
    wrap_plots(p1, p2)
    
    p1 / p2   #上下
    wrap_plots(p1, p2, ncol = 1)
    

    1.2 复杂布局

    (1)符号连接方式可以通过()调整优先级
    (p1 | p2) / p3 #先左右再上下
    
    p1 | (p2 / p3) #先上下再左右 
    
    (2)函数调用方式可通过设置design=参数,进行复杂布局
    • 有点类似基础绘图拼图的layout()函数
    design <- "AB
               CC"
    wrap_plots(A = p1, B = p2, C = p3, 
               design = design)
    
    design <- "AAD
               BCE"
    wrap_plots(B = p1, A = p2, C = p3, D = p4, E = p5,
               design = design)
    
    • 与上图等价的符号连接方式拼图代码如下。可见在更加复杂拼图需求时,还是使用函数调用方式更方便一点。
    ((p2 + p4) + plot_layout(widths = c(2, 1))) / (p1 + p3 + p5) 
    

    2、拼图细节调整

    2.1 plot_layout 调整长宽比例

    p1 + p2 + plot_layout(widths = c(3,2))
    wrap_plots(p1, p2) + plot_layout(widths = c(3,2))
    
    (((p1 / p2) + plot_layout(heights = c(1,2))) | p3) + plot_layout(widths = c(2,1))
    

    2.2 plot_layout 公用图形legend

    data(Salaries, package="carData") 
    p11 <- ggplot(Salaries, aes(x=rank, fill=sex)) +
      geom_bar(position="stack") + labs(title='position="stack"')
    p22 <- ggplot(Salaries, aes(x=rank, fill=sex)) +
      geom_bar(position="dodge") + labs(title='position="dodge"')
    p33 <- ggplot(Salaries, aes(x=rank, fill=sex)) +
      geom_bar(position="fill") + labs(title='position="fill"')
    p11 + p22 + p33 + plot_layout(guides = 'collect')
    

    2.3 plot_annotation 设置总图的title

    (p1 | (p2 / p3)) + plot_annotation(
      title = 'The surprising truth about mtcars',
      subtitle = 'These 3 plots will reveal yet-untold secrets about our beloved data-set',
      caption = 'Disclaimer: None of these plots are insightful')
    

    2.4 plot_annotation 设置子图的tag标签

    (p1 | (p2 / p3)) + 
      plot_annotation(tag_levels = 'A')
    # tag_levels : 'a', 'A', '1', 'i, or 'I'
    
    # tag标签加前缀
    ((p1 | p2) / p3) + 
      plot_annotation(tag_levels = 'A', tag_prefix = 'Fig. ') 
    # tag标签加后缀
    ((p1 | p2) / p3) + 
      plot_annotation(tag_levels = 'A', tag_suffix = ':')
    
    • 此外如果想要加个性化的标签,可以在绘制子图时单独添加tag
    p1 + labs(tag = "any")
    

    3、ggplot对象与其它对象的拼图

    3.1 ggplot对象 + 表格

    df = mtcars[1:10, c('mpg', 'disp')]
    p1 + gridExtra::tableGrob(df)
    

    3.2 ggplot对象 + 基础绘图

    p1 + ~plot(mtcars$mpg, mtcars$disp, main = 'Plot 2')
    

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