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如何获取旧版本的Bioconductor包

如何获取旧版本的Bioconductor包

作者: 可能性之兽 | 来源:发表于2023-09-03 18:13 被阅读0次

    以一个旧版本的 org.Mm.eg.db 包为例。在Bioconductor的包存档页面,所有的包都按照版本进行了分类。

    image.png

    以下是获取过程:

    1. 访问 Bioconductor 包存档页面:https://bioconductor.org/packages/3.14/data/annotation/ ↗

      这个链接是 Bioconductor 3.14 版本的数据注释包,你可以根据需要更改版本号。

    2. 使用页面的搜索功能,或者通过浏览页面来找到 org.Mm.eg.db 包。

    3. 点击包名,这将会带你到该包的页面。

    4. 在这个页面上,你可以找到 "Source Package" 链接,点击它就可以下载这个包的 tar.gz 文件了。

    在获取源代码之后,你可以在 R 中通过以下命令来安装这个包:

    install.packages(path_to_file, repos = NULL, type="source")
    

    其中 path_to_file 是你下载的包的路径。

    需要注意的是,旧版本的包可能依赖于旧版本的 R 和其他包,所以可能需要一些额外的工作来使它能够在新版本的 R 中运行。

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