安装openmm

openmm是分子动力学的开源仿真系统，提供了GPU和CPU安装方式。

在已经建立好的conda env环境安装openmm，如先用conda activate xxx激活xxx环境，在此环境中安装openmm。基于如下考虑，第一，方便openmm和其他程序包交互，如tensorflow或者pytorch。第二，在已经建立好的conda env环境安装，避免未知错误。

terminal窗口 命令行安装 

CPU版本

conda install -c conda-forge openmm

GPU版本 如cuda10

conda install -c conda-forge openmm cudatoolkit=10.0

这里，如果指定cuda版本，有时也会出现其他依赖包版本不匹配问题，建议去掉版本 conda install -c conda-forge openmm cudatoolkit 安装

安装好后，用如下命令行测试

python -m openmm.testInstallation

显示如下类似的信息，就说明安装成功了

Median difference in forces between platforms:

Reference vs. CPU: 6.29548e-06

Reference vs. CUDA: 6.7241e-06

CPU vs. CUDA: 7.71614e-07

Reference vs. OpenCL: 6.76294e-06

CPU vs. OpenCL: 8.10967e-07

CUDA vs. OpenCL: 2.22275e-07

All differences are within tolerance.