幽门螺杆菌（Hp）是慢性活动性胃炎、消化性溃疡、胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤和胃癌的主要原因。消化不良、原因不明的贫血和特发性血小板减少性紫癜也与之密切相关。Hp感染相关胃炎是一种传染病，检测阳性的患者应接受根除治疗。目前，没有任何治疗方案可以保证100%Hp根除率。Hp根除率与许多因素相关，包括治疗方案、患者对不良反应的耐受性、患者依从性、患者遗传多态性、吸烟、糖尿病和其他因素。其中，Hp的抗生素耐药性是Hp根除治疗失败的主要原因。而随着全球抗生素耐药率的上升，Hp的根除率持续下降。在这样的情势下，微生态辅助治疗可能成为一个新思路。
人体皮肤、消化道及呼吸道中含有大量的定植微生物，这些微生物在调节人体免疫功能、抵抗病原体定植方面起着重要作用。胃部环境虽然苛刻，但除Hp外，胃内仍存在非Hp微生物群落，如链球菌和葡萄球菌，称为胃微生态群。Hp感染可影响胃微生物群的平衡，报告显示Hp阴性受试者相比Hp阳性受试者的胃微生态群的多样性更高。
Hp的黏附和毒力因子是致病的主要原因。Hp在胃内定植影响胃部原始细菌的分布和数量，并扰乱微生态平衡，导致疾病。例如，与未感染Hp者相比，Hp感染者胃中的乳杆菌较少。Hp导致微生态失衡主要是因为其产生了抗菌肽cecropin。这种肽可以使其他细菌“自体自溶”。由于缺乏这些细菌的竞争，Hp可以不受控制地进行繁殖，其产生的一系列毒力因子刺激胃上皮细胞，导致细胞凋亡和炎症。因此，增加抗生素的剂量或延长抗生素的使用期可能不仅不会提高Hp根除率，还会导致抗生素耐药性增加。
微生态治疗为Hp根除带来了新思路。重塑胃中的微生态平衡可以减少Hp定植，研究表明，正常小鼠接受Hp悬浮液7天，由此产生的Hp感染率为30%；如果小鼠首先用庆大霉素和阿奇霉素的混合物喂养3天以消除胃内原始微生物群，则7天施用Hp可产生100%的Hp感染率；通过喂食乳杆菌和双歧杆菌悬浮液7天重建胃微生物群平衡后，Hp感染率降低至30%，Hp定植显著降低。研究结果支持了以下推测：免疫系统和正常的胃微生物群可以有效拮抗Hp的定植，而胃微生物群平衡的破坏增加了对Hp的易感性。该数据为临床使用益生菌提高Hp根除率提供了理论依据。
益生菌在Hp根除中的循证依据
许多荟萃分析和临床试验证实，补充益生菌可以提高Hp的根除率，减少根除期间的不良反应。从文献分析可以得出结论，并非所有益生菌都对Hp具有抑制作用，并且不同的益生菌具有特定的作用。益生菌混合菌株对Hp的抑制作用大于单一菌株。单独使用益生菌不能完全消除Hp，但可以减少胃中Hp载量，降低尿素呼气试验（UBT）的delta值，以及减轻胃黏膜炎症。益生菌可以通过抑制脲酶活性或降低Hp与胃黏膜的附着来降低DOB值，从而降低Hp密度。
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