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linux下无需解压查看压缩文件内容

linux下无需解压查看压缩文件内容

作者: 生信交流平台 | 来源:发表于2020-12-23 22:36 被阅读0次

    在linux系统下,我们如果要查看一个压缩文件里面的内容,一般我们会先解压这个文件,然后再通过cat,less,more或者head等命令来查看。当然在压缩文件很小的情况下是没有任何问题的,但是一旦压缩文件本身已经很大了,再去解压就会很耗时。今天小编给大家介绍一个linux下面的命令,在无需解压的情况下查看压缩文件的内容。

    zcat是一个命令行实用程序,用于查看压缩文件的内容,而无需对其进行解压缩。 它将压缩文件扩展为标准输出,使您可以查看其内容。 另外,zcat与运行gunzip -c命令完全相同。 zcat有如下参数

    -S:指定gzip格式的压缩包的后缀。当后缀不是标准压缩包后缀时使用此选项;
    -c:将文件内容写到标注输出;
    -d:执行解压缩操作;
    -l:显示压缩包中文件的列表;
    -L:显示软件许可信息;
    -q:禁用警告信息;
    -r:在目录上执行递归操作;
    -t:测试压缩文件的完整性;
    -V:显示指令的版本信息;
    -l:更快的压缩速度;
    -9:更高的压缩比。
    

    下面给大家举两个例子

    如果我们直接用cat来查看一个压缩文件,你会看到一串乱码

    如果用zcat就能顺利的看到压缩文件中的内容

    这条命令在查看测序的fastq.gz文件的时候特别实用,因为一般的测序数据都几十G上百G,你等解压缩好了再去看,既耗时又费劲。如果你只是想看下每条read的长度,或者查看一下index序列,统计一下reads条数等等,这种简单的任务,直接用zcat就可以了。

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