Metascape

作者: Stone_Stan4d | 来源:发表于2017-12-02 13:01 被阅读589次

    之前本来准备使用DAVID软件进行基因富集分析的,后来听说DAVID更新比较慢,最近一次更新是2016年,上一次的更新则是2012年,还是在被Nature点名批评之后进行的更新。另外,Metascape则操作亲(sha)民(gua),最重要的是数据更新及时,很多基因注释及时跟进。
    于是我准备转战Metascape

    • 打开主页,清新扑面而来:


      Metascape主页
    • 我愉快的提交了差异基因列表:


      提交基因列表
    • 她已经自动帮我选定了物种:


      自动识别物种
    • 立马她就上车了:


      点击Express Analysis

      静静的等待富集。

    • 结果就这么呈现了:


      分析结果

      我下载了PDF看看:


      点击即可下载
      我比较贪心,于是:
    • 打包下载所有数据:


    文件可以导入cytoscape里面进行修饰,有些数据用excel文件进行图示输出。


    i解压后的文件

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