之前本来准备使用DAVID软件进行基因富集分析的,后来听说DAVID更新比较慢,最近一次更新是2016年,上一次的更新则是2012年,还是在被Nature点名批评之后进行的更新。另外,Metascape则操作亲(sha)民(gua),最重要的是数据更新及时,很多基因注释及时跟进。
于是我准备转战Metascape。
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打开主页,清新扑面而来:
Metascape主页 -
我愉快的提交了差异基因列表:
提交基因列表 -
她已经自动帮我选定了物种:
自动识别物种 -
立马她就上车了:
点击Express Analysis
静静的等待富集。
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结果就这么呈现了:
分析结果
我下载了PDF看看:
点击即可下载
我比较贪心,于是: -
打包下载所有数据:
文件可以导入cytoscape里面进行修饰,有些数据用excel文件进行图示输出。
i解压后的文件
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