非靶plus
非靶代谢plus从发布至今已近两年,参与已发表SCI文献84篇,涵盖肿瘤、代谢疾病、心血管、肠道微生物、中医药、环境、畜牧、食品等多个方向,总计IF >520,其中多篇发表在Cell Metabolism,Diabetes Care,Circulation Research,Cell Reports, Journal of Experimental Medicine等Top期刊上。在此我们回顾产品运行情况和实测结果并向各位老师介绍我们近期改善产品的一些措施。
1 产品介绍
非靶代谢组学plus是中科新生命推出的第二代非靶向代谢组学产品,利用高分辨率LC-MS/MS平台对样本中的代谢物进行无偏向性检测,将下机数据匹配本地自建代谢物数据库(本地标准品库+商业数据库库)实现代谢物鉴定,该产品包含从代谢物提取,上机检测,生信分析全程流程非靶向代谢组学分析服务。
1.1 产品优势:
高质量数据库:本地初生标准品库整合商业数据库,数据均采集自高分辨率质谱平台,经人工过滤一级、二级谱图,RT(保留时间)矫正,代谢物鉴定水均在level 2以上;
高鉴定数:3万+代谢物数据库,平均项目鉴定代谢物数量1200+,最高鉴定数量3271(Score>0.6);
数据可靠:自有实验室、仪器平台和生信团队,实验过程、原始数据全程可追溯;
免费增值服务:专业售前支持团队与售后项目管理团队保证您在售中与售后的体验,数据支持APT-云平台在线自助分析。
1.2 技术路线:
1.3 数据库概览:
1.4 数据库构成评价:
基于该数据库实测尿液样本,并将结果与国际顶尖代谢组研究团队Fiehn实验室发布文献中尿液代谢物类型构成比较,发现结果可真实反应生物样本中的代谢物轮廓。
1.5数据库定性能力评价:
使用碳水化合物、氨基酸、核苷酸及功能代谢分子等数百种标准品Mix进行非靶代谢plus分析,检出率>90%,该数据获得行业专家认可。
非靶plus多次凭借精准的定性能力,协助研究者锁定关键代谢物分子及标志物,助力TOP文献发表。
合作项目中关键代谢物标志物的匹配镜像图2 产品回顾:
非靶plus产品运行期间,样本覆盖109个物种,涉及多种样本类型。如下展示部分已经交付的项目中物种、样本类型及鉴定结果。
2.1 物种及样本类型
临床样本
常见模式样本
畜牧、水产、微生物及其它
2.2 部分项目代谢物定性数量展示:
人源样本定性结果展示 图 特殊人源样本定性结果展示 *欢迎与我们联系,咨询样本经验3 产品升级:
数据库治理工作
近期我们以最新的KEGG代谢物数据库信息为准,更新了本地数据库中的代谢物名称及编号,提升了代谢plus结果中代谢物与KEGG通路数据库对应时的覆盖度,避免了研究者在数据分析过程中,还需要校对各数据库代谢物名称再进入各数据库查询的问题。
色谱体系升级
依靠大量项目积累,中科新生命完成了典型样本的色谱条件优化,针对细胞、组织、体液、粪便建立了不同的色谱体系,升级前后综合提升了代谢物鉴定数量近15%。
4 合作文献展示:
*更多项目文章欢迎联系我们最后再次感谢广大科研工作者对我们的信任,得以让我们参与到如此众多的科研工作中来,后续我们会继续为大家提供高品质的代谢组学服务。
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