Mustache

Mustache: multi-scale detection of chromatin loops from Hi-C and Micro-C maps using scale-space representation

MUSTACHE，一种从 Hi-C 和 Micro-C 接触图中多尺度检测染色质环的新方法。MUSTACHE利用比例空间理论，一种计算机视觉技术，来检测接触地图中的斑点状物体。MUSTACHE 可扩展到千碱基分辨率映射和报告loop，这些循环在复制之间以及 Hi-C 和 Micro-C 数据集之间具有高度一致性。与 HiCCUPS 和 SIP 等其他loop calling方法相比，MUSTACHE 获得了更多已发表的 ChIA-PET 和 HiChIP 循环以及连接启动子和调控元件的loop。总的来说，MUSTACHE 能够对染色质环进行有效和全面的分析。网址: https://github.com/ay-lab/mustache。