ANCOM

作者: Thinkando | 来源:发表于2020-03-26 23:40 被阅读0次

三、ANCOM差异分析

  • ANCOM(Analysis of composition of microbiomes)是另外一种比较微生物组学数据中物种在组间的显著性差异的分析方法。ANCOM分析不依赖于数据的分布假设,克服了相对丰度分析法的一些限制,能够有效降低结果的假阳性,更准确的分析各分类水平的物种在组间的差异情况。使用QIIME2可进行ANCOM分析。
    QIIME2:https://qiime2.org/

1. 结果展示:

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2. 结果说明:

  • 在ANCOM分析中,W值是一个衡量组间差异显著性的统计量(类似F值,t值),W值越高,代表该物种在组间的差异显著性越高。图中的每一个点都代表了一个比较的物种,纵坐标代表W值,横坐标clr值代表组间样品丰度的差异程度,数字绝对值越高代表相对丰度差异越大。因此在图中的点越靠近右上角(或左上角),则代表该物种与其他物种(靠近横轴0位置的物种)相比更具有显著性差异。

ANCOM:找出微生物群落中的差异物种

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