作者，Evil Genius
我们课上没有讲解SPATA2，这一篇文章我们来补充
目前SPATA2 已经升级到3.0，更新了很多的分析方法，包括HD，我们先来感受一下分析上的更新
CNV
HD分析
今日参考文献
空间转录组的核心分析点之一：识别关键的组织形态生态位
空间基因表达梯度
结果1、DEA（ differential expression analysis ）预测具有空间依赖性的基因表达是不可靠的
空间基因梯度分析优于区域差异基因
空间基因梯度识别空间区域相关的空间基因表达模式，为新的见解铺平了道路。
结果2、空间转录组学研究中基因表达混杂因素的鉴定
空转分析肿瘤样本由于其异质性和混沌性，使得聚类算法难以识别最佳空间区域，识别标记基因和空间niche。
结果3、T细胞丰度和缺氧代谢的空间动力学
空间参考特征-空间注释或空间轨迹
SPATA2目前更新的方法部分
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