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pheatmap画热图

pheatmap画热图

作者: 白云梦_7 | 来源:发表于2019-03-19 17:22 被阅读0次
    bym_3w+4w_DEG.txt
    f<-read.table("bym_3w+4w_DEG.txt",header = T,row.names = 1,sep = "\t")
    anno_col=data.frame(sampleType=factor(c(rep("w3",5),rep("w4",4),rep("gk3",5),rep("gk4",5))))#设置注释条,样本的分组情况
    ann_color=list(sampleType=c(gk3="red",gk4="blue",w3="tomato",w4="dodgerblue"))#注释条的颜色
    row.names(anno_col)=colnames(f)
    #匹配
    color<-colorRampPalette(c('#436eee','white','#EE0000'))(100)#设置右侧条形图颜色,这里是蓝白红
    pheatmap(f,scale="row",color = color,annotation_col = anno_col,annotation_colors = ann_color,fondsize=8,fonsizerow=4,show_colnames=T,main="",show_rownames = F,cluster_cols = F)#这里不显示列名,即样本名
    color<-colorRampPalette(c('#436eee','white','#EE0000'))(100)#设置右侧条形图颜色,这里是蓝白红
    
    deg_heatmap.png

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