双端组装时reads1 file与reads2 file不完全m

作者: 胡童远 | 来源:发表于2021-03-19 10:35 被阅读0次

在用metaspade组装双端fastq，或用megahit组装双端fasta时，因双端不齐会报告相应的error。

这里保存biostars的经验方案：https://www.biostars.org/p/142407/

1 使用mothur list.seqs remove.seqs功能
2 使用BBMap repair.sh功能

解决思路：
1 使用软件删除非双端的序列
2 删除质量值与碱基数长度不匹配的序列
3 合并文件，采用单端组装方法

双端组装时reads1 file与reads2 file不完全m
在用metaspade组装双端fastq，或用megahit组装双端fasta时，因双端不齐会报告相应的error...
ffmpeg 合并.m4a文件
ffmpeg -i file1.m4a -acodec copy file1.aac ffmpeg -i file...
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