前言
俗话说“文献是最好的老师”,但是隔行如隔山,在科研界,隔着一个领域就有一个巨大的鸿沟。就比如就算做肿瘤研究的人,看免疫学领域的文章还是会头皮发麻,看到总是记不住的CD4+ T细胞,CD8+ T细胞,各种CD分子就能让人头秃。不做表观遗传的人,看到甲基化,泛素化,乙酰化就害怕的想往后退。但学习的过程,就是把自己那胆小的脑细胞安抚一下,客服困难后获取知识的感觉如沐春风。
m6A甲基化,咋一听名字我就是拒绝的。甲基化我可以理解,m6A又是什么?它的功能是什么? m6A甲基化,对我来说就是一张白纸,我除了一个名字,全然不知。
以下将是一个m6A甲基化小白的拆解式了解
本文参考的文章有:RNA甲基化修饰——m6A概念,重磅前沿 https://www.ebiotrade.com/newsf/2018-5/201857103154270.htm (这是一篇非常言简意赅的文章,请一定要阅读)
m6A甲基化是什么?
一看到甲基化就想到修饰,这个原因不加解释了。一直以为我从未关注过中心法则中的RNA,也未考虑过RNA也需要修饰。实际上已知RNA已经存在超过100中修饰,下面是我在谷歌中找到的图
imageRNA processing begins with the addition of a 5'-cap and a 3'-poly(rA) tail to the pre-mRNA. The protein coding region contains coding sequences called exons. The exons are spliced together to form the mature mRNA.
图中所示的5’cap和3‘的Poly A尾,就是RNA修饰,加帽和加尾肯定会使得这条RNA和pre-mRNA的功能有了变化,由此我们联想到RNA,也是有不同的变化(状态)的。结合果子老师之前的推文介绍,我大概了解到,RNA可以从前体变成熟,可以翻译也可以不翻译,可以蓄积也可以降解。而m6A甲基化就是一种可以改变RNA状态的修饰。
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image这张图里,m6A甲基化就像是RNA的标签,由WTAP,METTL3和METTL14组成的复合物写入,之后会由阅读器过来阅读从而发挥作用,不同的阅读器发挥的功能不一样,我们比较熟悉的是YTHDF2,他阅读m6A甲基化后促进RNA降解。写入的m6A甲基化如果不擦除会失调,所以还有一些蛋白作为擦除器,专门擦除m6A甲基化,已知的两个是FTO和ALKBH5。
这张图解决了,它是谁,它从哪里来,将要哪里去的问题
(1)m6A甲基化,由Pre-mRNA-splicing regulator WTAP , N6-adenosine-methyltransferase 70 kDa subunit (METTL3) 和METTL14等蛋白写入。好吧,这些可都是剪接调节因子或者甲基转移酶呀。有甲基化,自然也就有去甲基化,那么就是通过the first m6A demethylase, fat mass and obesity-associated protein (FTO),the 2nd m6A demethylase--m6A demethylase alkB homolog 5 (ALKBH5)起作用。 FTO是第一个被发现的m6A去甲基化酶,ALKBH5是第二个。
(2)m6A甲基化的mRNA,经过阅读器(猜测是核糖体之类的东西,如有错误,请不吝赐教)阅读后,该mRNA可能会翻译,可能会保持稳定不变或者降解,可能会被剪切,可能也会发生核转位(出核)
(3)既然m6A甲基化对蛋白表达、剪接体的形成还有mRNA定位都有重大影响,这就预示着m6A甲基化会对非常多的生物学过程具有重要意义。
看到这里,不由的点点头,嗯,m6A甲基化真的很重要呢!
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