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conda安装bioperl模块之后还是不能调用其中的模块

conda安装bioperl模块之后还是不能调用其中的模块

作者: Bioinfor生信云 | 来源:发表于2021-11-11 14:39 被阅读0次
    image.png

    我第一次遇到这种情况的时候,在网上查了很多的教程,试过各种方法,以及重新安装相应的模块还是不能解决,在各种折磨之后终于找到了原因。

    查看conda安装bioperl后的存储的位置

    
    conda list
    
    
    image.png

    查看miniconda3目录下,可以看到实际上我们已经安装上了Bio::Seq模块

    image.png
    bioperl模块的位置,不在 perl 的@INC里

    把我们查到的模块路径选择一个安装到perl环境变量里面

    
    export PERL5LIB=/home/data/t0202008/miniconda3/pkgs/perl-bioperl-1.6.924-4/lib/perl5/site_perl/5.22.0/:$PERL5LIB
    
    

    问题就解决啦

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