美文网首页
R数据处理之长宽数据转换

R数据处理之长宽数据转换

作者: 小明在做游戏 | 来源:发表于2021-09-09 08:29 被阅读0次

100天生信-Day6

长数据和宽数据是满足不同分析的两种数据格式,可以很方便用R的reshape2包转换,代码如下:

library(reshape2)

## long -> wide
setwd("PATH")  
long <- read.csv("long.csv" , header = T)
colnames(long)
wide <- dcast(long, Gene_name ~ Cis_element)
write.csv(wide,'wide.csv',row.names = FALSE)

## wide -> long
setwd("PATH")  
wide <- read.csv("wide.csv" , header = T)
colnames(wide)
long = melt(wide, id=c("Primer"),
                  variable.name= 'FR', value.name = 'Seq')
write.csv(long,'long.csv',row.names = FALSE)

参考教程:https://cloud.tencent.com/developer/article/1369874

相关文章

网友评论

      本文标题:R数据处理之长宽数据转换

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/rlciwltx.html