学习小组Day7笔记-zkh

作者: zZ_f79f | 来源:发表于2020-11-29 23:57 被阅读0次

测序

Sanger测序

ddNTP
测序读长长(1000bp),准确
通量低

二代测序 PE(Pair End双端)

边合成变测序(sequence by synthesis, SBS)

  • DNA文库构建
  • 桥式PCR
  • 测序
  • 数据产出
    高通量,读长短,错误率高

三代测序

  • PacBio 实时单分子测序
  • 复合探针-锚定连接技术
  • 纳米孔单分子通道技术
  • Ion Torrent电子流检测技术


    测序.png

1.基因组学(核酸序列分析)

(1)全基因组测序(WGS)
(2)全外显子组测序(WES)
(3)简化基因组测序(RRGS)
①RAD-Seq
②GBS
③2bRAD
④ddGBS(也就是ddRAD)

2.转录组学(基因表达分析)

(1)mRNA-Seq
(2)IncRNA-Seq(长链非编码RNA)
(3)sRNA-Seq(主要是miRNA-Seq)

3.蛋白质组学

(1)蛋白质组数据处理、蛋白及其修饰鉴定
(2)构建蛋白质数据库、相关软件的开发和应用
(3)蛋白质结构功能预测
(4)蛋白质连锁图

4.代谢组学

(1)代谢物指纹分析
(2)代谢轮廓分析


组学.png

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