学习小组Day7笔记-zkh

作者: zZ_f79f | 来源:发表于2020-11-29 23:57 被阅读0次

    测序

    Sanger测序

    ddNTP
    测序读长长(1000bp),准确
    通量低

    二代测序 PE(Pair End双端)

    边合成变测序(sequence by synthesis, SBS)

    • DNA文库构建
    • 桥式PCR
    • 测序
    • 数据产出
      高通量,读长短,错误率高

    三代测序

    • PacBio 实时单分子测序
    • 复合探针-锚定连接技术
    • 纳米孔单分子通道技术
    • Ion Torrent电子流检测技术


      测序.png

    1.基因组学(核酸序列分析)

    (1)全基因组测序(WGS)
    (2)全外显子组测序(WES)
    (3)简化基因组测序(RRGS)
    ①RAD-Seq
    ②GBS
    ③2bRAD
    ④ddGBS(也就是ddRAD)

    2.转录组学(基因表达分析)

    (1)mRNA-Seq
    (2)IncRNA-Seq(长链非编码RNA)
    (3)sRNA-Seq(主要是miRNA-Seq)

    3.蛋白质组学

    (1)蛋白质组数据处理、蛋白及其修饰鉴定
    (2)构建蛋白质数据库、相关软件的开发和应用
    (3)蛋白质结构功能预测
    (4)蛋白质连锁图

    4.代谢组学

    (1)代谢物指纹分析
    (2)代谢轮廓分析


    组学.png

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