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2018-07-07(关于DESeq2安装过程中的一点问题)

2018-07-07(关于DESeq2安装过程中的一点问题)

作者: 天秤座的机器狗 | 来源:发表于2018-07-07 21:44 被阅读117次

今天在学习转录组的时候,做差异基因的时候,需要安装DESeq2.

首先,DESeq2是R中的一个包,需要在R中安装加载

首先打开R

在R中输入:

source("http://bioconductor.org/biocLite.R") # 调入安装工具Bioconductor

biocLite("DESeq2")# 安装DESeq2

library("DESeq2")

在第二步的时候出了问题

提示R包的安装路径不可写

于是先查看R包的安装路径

打开R

然后键入:

.libPaths()

查看安装路径

然后将路径的所有的的子目录全部改成777

用sudo chmod -R 777 directory

然后就可以正常运行了

另外R包的安装常见的还是install.packages(" ")

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