今天在学习转录组的时候,做差异基因的时候,需要安装DESeq2.
首先,DESeq2是R中的一个包,需要在R中安装加载
首先打开R
在R中输入:
source("http://bioconductor.org/biocLite.R") # 调入安装工具Bioconductor
biocLite("DESeq2")# 安装DESeq2
library("DESeq2")
在第二步的时候出了问题
提示R包的安装路径不可写
于是先查看R包的安装路径
打开R
然后键入:
.libPaths()
查看安装路径
然后将路径的所有的的子目录全部改成777
用sudo chmod -R 777 directory
然后就可以正常运行了
另外R包的安装常见的还是install.packages(" ")
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