tryCatch({
pdf(paste0(dir,"/Pathway-bubble-",pathways.show,'-',ct_name, ".pdf"))
netVisual_bubble(cellchat, sources.use = ct,signaling = pathways.show,remove.isolate = F) %>% print()
dev.off()
}, error = function(e) {
dev.off()
cat("Error")
})
两个踩的坑:
- 必须得加
%>% print()
才能打印图到pdf - 如果报错,必须得加
dev.off()
关闭图形设备,否则后面的图会全部画不出来
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