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代码库13-CellChat批量存图

代码库13-CellChat批量存图

作者: 江湾青年 | 来源:发表于2024-04-21 17:39 被阅读0次
    tryCatch({
        pdf(paste0(dir,"/Pathway-bubble-",pathways.show,'-',ct_name, ".pdf"))
        netVisual_bubble(cellchat, sources.use = ct,signaling = pathways.show,remove.isolate = F) %>% print()
        dev.off()
    }, error = function(e) {
        dev.off()
        cat("Error")
    })
    

    两个踩的坑:

    1. 必须得加%>% print()才能打印图到pdf
    2. 如果报错,必须得加dev.off()关闭图形设备,否则后面的图会全部画不出来

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