聚簇索引是一种数据存储方式，它实际上是在同一个结构中保存了B+树索引和数据行，InnoDB表是按照聚簇索引组织的（类似于Oracle的索引组织表）。
InnoDB通过主键聚簇数据，如果没有定义主键，会选择一个唯一的非空索引代替，如果没有这样的索引，会隐式定义个主键作为聚簇索引。
对于非聚簇索引表来说（右图），表数据和索引是分成存储的，主键索引和二级索引存储上没有任何区别。
而对于聚簇索引表来说（左图），表数据是和主键一起存储的，主键索引的叶结点存储行数据，二级索引的叶结点存储行的主键值。
聚簇索引表最大限度地提高了I/O密集型应用的性能，但它也有以下几个限制：
1）插入速度严重依赖于插入顺序，按照主键的顺序插入是最快的方式，否则将会出现页分裂，严重影响性能。因此，对于InnoDB表，我们一般都会定义一个自增的ID列为主键。
2）更新主键的代价很高，因为将会导致被更新的行移动。因此，对于InnoDB表，我们一般定义主键为不可更新。
3）二级索引访问需要两次索引查找，第一次找到主键值，第二次根据主键值找到行数据。
二级索引的叶节点存储的是主键值，而不是行指针（非聚簇索引存储的是指针或者说是地址），这是为了减少当出现行移动或数据页分裂时二级索引的维护工作，但会让二级索引占用更多的空间。
聚簇索引的叶节点就是数据节点，而非聚簇索引的页节点仍然是索引检点，并保留一个链接指向对应数据块。
聚簇索引主键的插入速度要比非聚簇索引主键的插入速度慢很多。
相比之下，聚簇索引适合排序，非聚簇索引不适合用在排序的场合。因为聚簇索引本身已经是按照物理顺序放置的，排序很快。非聚簇索引则没有按序存放，需要额外消耗资源来排序。
当你需要取出一定范围内的数据时，用聚簇索引也比用非聚簇索引好。
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