提取烟草基因启动子

作者: 队长的生物实验室 | 来源:发表于2023-05-20 23:04 被阅读0次

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简单来说，主要步骤为使用烟草中关注的基因的核苷酸序列在 SGN 网站( https: / /solgenomics. net/) 进行序列比对，下载序列后提取ATG前2000bp即为烟草中目的基因的启动子部分。

具体步骤
1.打开https://solgenomics.net/tools/blast/网站，选择物种（选择烟草）、数据库（选择烟草基因组）、程序进行blast；

以目的基因序列为query序列blast
2.打开比对结果中排名最靠前的序列，下载fasta格式序列；

下载序列
3.使用snapgene打开，挑选ATG前2000bp序列即为这条基因的启动子序列。

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