因为边南临近外邦,所以驻防边南军州的部队比较多一些,原来朝廷有一支边南军(设边南军节度使管理),边南军当时实行军府制度,每军下设九个府(设总兵管理),每府直接拥有府兵五千余人常备军,每府又下设九个镇(设镇守使管理),每镇又拥有一千余人的常备军,大多由当地的军户出人从军。
泉皇三世执政末期,泉联与南北邻邦签订了《边境安全相互信任协定》、《边境安全事务磋商机制准则》等。泉皇三世决定按照内州制度,设置边南军州、边北军州两个边境州。取消军府制度( 取消军府制度后,边南军州的行政管理体系由军事化转向民事化。各级行政机构的设置更加注重民事管理和公共服务 ),各府、镇兵马统撤,命南卫将军麾下营兵驻守。将原节度使的职责一分为五 ,为刺史、监察史、军政使、按察使、民政使五职。
目前,边南军州拥有驻军十个营,约一万八千人。
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