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PCA主成分分析-python和SPSS对比

PCA主成分分析-python和SPSS对比

作者: 一天天111 | 来源:发表于2019-10-22 09:09 被阅读0次
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    特征值对应的特征向量就是理想中想取得正确的坐标轴,而特征值就等于数据在旋转之后的坐标上对应维度上的方差。

    通常情况,数据量巨大且并非所有数据都能连成一条线。

    这时候我们要找到一个维度(一个向量),让所有数据投影(降维)到该向量上之后,尽可能地分散。因为越分散说明通过该向量降维之后数据得以很好地区分,越紧凑说明该降维导致了越多信息丢失。数学上表达“分散”的方式之一就是:方差。方差越大,则说明数据越分散

    为了计算方差方便,对数据进行去均值(即以各维度的均值所指明的点为中点)。接下来我们要找到一个单位向量(为了计算方便)使得投影后数据最分散,即方差最大:

    1.导入相关模块:

    import pandas as pd
    import numpy as np
    import matplotlib.pyplot as plt
    

    2.导入数据:

    import os
    os.chdir("/Users/liyili2/Downloads/datas/")
    data=pd.read_csv("factor1.csv")
    data=data.drop('序号',axis=1)
    data_features=data.iloc[:,1:]
    data.head()
    

    3.进行降维:

    from sklearn.decomposition import PCA
    pca=PCA(n_components=0.89)
    pca.fit(data_features)
    print("特征值是:%s"%pca.explained_variance_)    #特征值
    print("特征向量是:%s"%pca.components_)            #特征向量
    print("成分个数是:%s"%pca.n_components_)        #成分个数
    print(pca.explained_variance_ratio_)           #返回所保留的n个成分各自的方法百分比
    x_pca=pca.transform(data_features)#用X来训练PCA模型,同时返回降维后的数据,这里的x_pca是降维后的数据
    print("x_pca",x_pca[:5])
    x_new=pca.inverse_transform(x_pca)#将降维后的数据转换成原始数据
    print('original shape',data_features.shape)
    print('transformed shape',x_pca.shape)
    print(x_pca[:5])
    
    #降维后可视化咋操作
    #c的值怎么确定啊!!!,不明显啊
    colors=np.random.rand(30)
    plt.scatter(x_pca[:,0],x_pca[:,1],c=colors,edgecolor='none',alpha=0.5,cmap='Reds',s=5)
    plt.axis('equal')
    plt.grid()
    plt.colorbar()
    
    结果:
    特征值是:[3011311.0188587  1926192.37121641]
    特征向量是:[[ 7.58192067e-01  3.07331923e-01  2.19659649e-01  4.47991226e-01
       9.55259672e-02 -3.41757191e-04 -5.25326480e-04  2.69480567e-01]
     [-4.71076647e-01  3.53975814e-01 -6.23952261e-02  7.46167612e-01
      -2.43123379e-01  2.52583659e-05 -4.97252960e-04 -1.81712466e-01]]
    成分个数是:2
    [0.56089678 0.35877898]
    x_pca [[ 1010.73256745  2602.64884973]
     [ -130.6189745   1742.26121954]
     [  554.58843503 -1476.24842192]
     [-1194.42488029  -295.95861306]
     [-1689.77830869  -525.80230496]]
    original shape (30, 8)
    transformed shape (30, 2)
    [[ 1010.73256745  2602.64884973]
     [ -130.6189745   1742.26121954]
     [  554.58843503 -1476.24842192]
     [-1194.42488029  -295.95861306]
     [-1689.77830869  -525.80230496]]
    
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