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R语言: as.dist()

R语言: as.dist()

作者: LET149 | 来源:发表于2023-10-29 10:00 被阅读0次

    作用: 将数据框转换成 dist(距离) 这种数据格式;这种数据格式会在绘制 进化树 时使用

    可能需要此函数配合的包:ape

    将数据框转换成 dist 时的实际操作:取数据框的 下三角

    1. 使用示例一

    > kk <- read.table("/home/zhiyong/Desktop/ZZZZZZZZZZZ/kk.txt")
    > kk
       aa bb cc dd
    aa  1  2  3  4
    bb  5  6  7  8
    cc  9 10 11 12
    dd 13 14 15 16
    > class(kk)
    [1] "data.frame"
    > 
    > pp <- as.dist(kk)
    > pp
       aa bb cc
    bb  5      
    cc  9 10   
    dd 13 14 15
    > class(pp)
    [1] "dist"
    

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