Evolview（三）

Evolview简介

Evolview是一款在线进化树注释软件，能够实现很复杂的注释效果，且用法并不复杂。使用该网站需要注册账号，设置完毕的进化树也会长期保存。

网站地址：https://evolgenius.info//evolview-v2/#login

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使用方法

1.导入进化树文件
Evolview能够接收Newick、NHX、PhyloXML和Nexux等格式的进化树文件，比如MEGA等软件输出的Newick文件，见下图：

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2.进化树基础设置
导入进化树后需要进行一些调整，例如字体大小、枝的粗细、进化树形状等等，如下图，可以方便利用方框内相应选项进行设置。

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3.设置分支、标签及其背景颜色
在"Annotation upload"中可选择设置分支、标签以及背景颜色，如下：

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注释的格式为：location，color，commands，共三列，由制表符分隔。
location：叶节点，也可为由逗号分隔的2个叶节点
color：分支、标签或背景颜色
commands：控制命令（可不设）
由于篇幅限制，具体的格式语法就不说了，大家可在上上图中的帮助查看，讲的非常详细，一定要看哦。

4.设置标签装饰

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格式：location shape,color[:stroke_color]
location：一个叶节点的名称
shape,color[:stroke_color]：装饰形状（shape），填充色（color），边框色（stroke_color）。
至少有2列：由制表符分隔。可以设置多列，格式和作用与第2列相同，即一个标签可以设置多个装饰图形。
形状类型：triangle(三角形)、circle(圆形)、rect(矩形)、star(星形)、check(勾形)
具体语法请见帮助。

5.设置分组标签

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设置语句含2列，以制表符分隔。
第1列：可以是一个叶节点，或者由逗号分隔的2个叶节点
第2列：设置文字标签（text=label，必须）和格式参数（color=可选）

具体语法请见帮助。

6.显示Bootstrap值
点击 “Basic > show/hide bootstrap scores” 打开bootstrap值的显示开关。

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点击“Annotation upload > upload data for Boostrap value styles”。

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设置语句分为2列，由制表符分隔。
第一列：bootstrap值的范围，一个值，或者由逗号或冒号分隔的2个值
第二列：bootstrap值的显示格式参数 具体语法请见帮助。

7.其他设置
除此之外，还可在图中添加柱状图、热图、点图、蛋白质结构图等。

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最后，高颜值的进化树图就诞生啦！

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