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转录组入门1-环境配置与基础技能

转录组入门1-环境配置与基础技能

作者: 青山屋主 | 来源:发表于2020-10-07 10:37 被阅读0次

    写在前面:本内容面向无服务器、无生信团队可依靠的个人小白学习者。本系列文章是我知乎专栏《学习·持续输出》转录组入门中的内容重新整理和更新,本系列内容得益于生信技能树、生信媛、果子学生信、基因课、高通量测序技术等公众号长期推广生信分析技术,在此向这些公众号及其创立者、运营者一并表示感谢!!

    原文链接:https://zhuanlan.zhihu.com/p/27670618

    以下为更新内容:


    1.生信入门推荐环境

    目前对于个人小白学习者,推荐使用Win10系统的Ubuntu子系统(WSL),主要优点有:

    1.节省资源,操作简单。不需要另外购买电脑安装Ubuntu系统,同时也避免了对新手极不友好的系统安装、双系统安装(一个电脑同时安装2个系统)或者虚拟机安装等等繁琐而又容易出错的步骤,为初学者节省大量时间。

    2.跳过了部分Linux系统的知识,方便新手专注于测序数据分析。安装Ubuntu系统需要了解基本的Linux系统的知识,这些知识新手初学起来可能非常迷茫。另外Linux系统的文件操作也需要一定的练习量,Win10系统的Ubuntu子系统可以大大减少这些练习(比如复制粘贴,目录切换,解压缩等操作)。

    当然也有缺点,那就是这种子系统可能会让没有Linux系统知识的小白更加弄不清Linux系统的基本结构,进而出现很多基础性错误。

    具体操作方法:

    简书文章:win10 子系统的安装及卸载

    徐洲更B站视频:「转录组入门生信」在Windows10上配置一个Linux环境

    2.Linux基础技能

    2.1 Linux文件管理

    徐洲更B站视频:https://b23.tv/av62588575

    Linux基础命令

    2.2 Vim操作

    徐洲更B站视频: https://b23.tv/av58673256

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