测序知识
- 区分一二三代
- 二代流程
- NGS组学
测序过程和原理
一代sanger sequencing
sanger sequencing.png
- 测序读长可达1000bp，准确性高达99.999%
- 聚合酶活性下降，一次只测一条，通量低
二代测序
- Roche：454技术
- illumina：Solexa/Hiseq
- ABI：SOLID技术
illunima Hiseq 测序原理
PE (Pair End)
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flowcell： 测序反应的载体/容器，1个flowcell有8个lane
flow cell.png
- lane： 测序反应的平行泳道，试剂添加、洗脱等过程的发生位置
- tile： 每次荧光扫描的位置，肉眼是看不到的
- 双端测序： 可能序列比较长有四五百bp，两边各测120-150bp
- junction： 双端测序中间一些没有测到的区域
- flowcell构造：一个lane包含两列（swath），每一列有60个tile，每个tile会种下不同的cluster，每个tile在一次循环中会拍照4次（每个碱基一次）
-sequence by synthesis SBS
原理介绍视频：https://share.weiyun.com/5qojuBY 密码： 密码：bxsry4
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学习小组Day7思维导图-一二三代测序.png
day7学习未完待续
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