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如何使用SPDE进行基因家族分析---热图、共表达调控网络、韦恩

如何使用SPDE进行基因家族分析---热图、共表达调控网络、韦恩

作者: 许东 | 来源:发表于2021-10-08 08:44 被阅读0次

    如题所示的这几种图没什么好说的,本文集前面已经有了足够的介绍,在这里就向大家再强调一下输入文件的格式吧:

    热图:

    这就是一个计算基因表达量最常见的一个,什么处理,什么基因表达是多少,整理这样一个文件之后就可以交给SPDE了。

    共表达调控网络。文件一共就只有两列。第一列是HUB基因;第二列是edge基因。

    韦恩图。就是一列,大家将想要展示的东西放在不同的文件中,然后依次拖入文件框就好:

    GO富集分析图。这个需要借助REVIGO网站做就好,前面已经提到不再赘述。

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