蛋白质分子量 蛋白质是由许多氨基酸残基通过肽键(一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基脱水缩合形成的化学键)...[作者空间]
一、 写在前面 2023年4月中旬自己开始做基因家族的分析,对于这块自己没有接触过,因此也是一个挑战,没事!!!(...[作者空间]
前言 近两天在做基因家族的分析,这是第一次接触这块,很多不是很了解。在筛选同源蛋白序列的时候,以前都是使用BLAS...[作者空间]
2023.4.14 本文记录从Genome-wide analysis of cytochrome P450 ge...[作者空间]
NCBI CDD地址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/bwrpsb/...[作者空间]
本文主要工作:对SBT基因家族的基因结构进行可视化呈现 4.2 基因结构可视化 可视化基因结构,无非就是展示基因区...[作者空间]
本文主要工作内容:(1)使用HMM和NCBI-CDD对基因家族进行鉴定(2)使用几个网站对基因家族表达蛋白质的简单...[作者空间]
启动子 启动子是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列,它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需...[作者空间]
今天小白带大家来看一篇2022年9月份发表在SCI分区Q1区[Frontiers in Plant Scien...[作者空间]
画出美美的SeqLogo图,下面介绍三种不同的方法,适用不同的人群的需求。 1、直接上在线绘制SeqLogo图的网...[作者空间]
https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s1...[作者空间]
一个字-好用,两个字-麻烦,这不矛盾,真的! 1.下载 https://github.com/wyp1125/MC...[作者空间]
在基因家族分析中,通过pfam数据库检索获得已知基因家族的hmm模型(隐马模型)是必不可少的一步,最近发现pfam...[作者空间]
以MYB为例 从pfam网站下载Myb_DNA-binding.hmm 验证提取到的MYB蛋白是否都具有MYB的结...[作者空间]
常规的MEME和进化树可视化,以及其它基因结构/注释信息结合进化树可视化,TBtools已经做的很好https:/...[作者空间]
分析的过程可能下次会写。 我们用到一个r包 library(tidyverse) library(RColorBr...[作者空间]
基操勿6,直接进不去哈哈,等一会儿,喝杯咖啡。 这个是批量分析链接 ,一般都是走量吧。SMART: Batch a...[作者空间]
本节介绍一款在线绘制基因结构的工具Gene Structure Dispaly Server(GSDS),简单好用...[作者空间]
基因组数据的准备 进行全基因水平的基因家族鉴定之前,需要准备好一套基因组数据,基因组数据可以从公共数据库下载,也可...[作者空间]
基因家族的概念 基因家族 : 来源于同一个祖先,由一个基因通过基因复制而产生的两个或多个拷贝而构成的一组基因,他们...[作者空间]