美文网首页文章套路临床预测文章wx
22分的预测模型构建文章是一种怎样的水平?(上)

22分的预测模型构建文章是一种怎样的水平?(上)

作者: 医科研 | 来源:发表于2019-10-20 23:23 被阅读0次

作者:白介素2

基本介绍

近年来,基于分子表达谱等数据构建预测模型类文章呈现爆炸式增长,太过于普遍,逐渐成为常规了,甚至提不起什么兴趣,来看看22分的预测模型文章该是一个怎样的水平吧? 不要把做科研做成上中学时候的考试做题了,我们不是在为了做出一道题,完成一份试卷;我们是在探索未知、开拓人类认知的新边疆。


image.png

偶然看到这篇文章的,斯坦福大学医学院2017年发表在 JAMA Oncology杂志上,现在的影响因子是 22.416

文章标题为:Development and Validation of an Individualized Immune Prognostic Signature in Early-Stage Nonsquamous Non-Small Cell Lung Cancer. 这种标题咱们见得多了,太熟悉了。

摘要

重要性:这种早期肿瘤的发病率高需要可靠的预后生物标志物来鉴定复发风险高的患者,以指导辅助治疗。

研究目的: 为了开发出强大的基于个体化的免疫预后标志物,可以估计这种早期患者的预后。

研究设计

这项回顾性研究分析了来自19个公共NSCLC队列的冷冻肿瘤组织样本的基因表达谱,包括18个微阵列数据集和1个来自 TCGA的 RNA-Seq数据集。仅包括具有临床信息的肿瘤患者。样本来自2414例非鳞状NSCLC患者,分为meta训练队列(729例),meta测试队列(716例)和3个独立验证队列(439、323和207例)。所有患者均接受了手术切缘阴性的手术,未接受任何辅助或新辅助治疗,并且具有可公开获得的基因表达数据和生存信息。数据收集自2016年7月22日至9月8日。

讨论

单从研究的目的,重要性来看,大家都是这么想的,没有什么很难理解的地方。一个比较好的点可能就是研究的是早期的肿瘤、不像有些研究随便拿个肿瘤完整数据集拿出来就做了、构建模型。这样做的方式临床意义不大、而对于分期的肿瘤患者有更好的指导意义。

研究设计上,将多个芯片数据与测序数据整合、再分为训练集、验证集和测试集,技术上有一定的难度,而且融合起来有观点是排斥的、但是人家做了。

本期先到这里吧,预知后事如何,请听下回分解,我是白介素2,下期再见。

参考资料

https://jamanetwork.com/journals/jamaoncology/fullarticle/2643120

相关文章

  • 22分的预测模型构建文章是一种怎样的水平?(上)

    作者:白介素2 基本介绍 近年来,基于分子表达谱等数据构建预测模型类文章呈现爆炸式增长,太过于普遍,逐渐成为常规了...

  • Python 机器学习之使用 AUTO ARIMA + PROP

    在这篇文章中,我展示了一种开始构建可以预测值的机器学习模型的方法,以及它与监督机器学习模型的不同之处。作为奖励课程...

  • 2018-12-01Model Predictive Contr

    模型预测控制的定义:MPC是一种基于模型的闭环优化控制主要思想:根据模型当前的状态和输入,以及所构建的系统模型来预...

  • 使用randomForest包进行随机森林分析

    1. 简介 随机森林是机器学习中的一种分类算法,这个算法在之前分享的TCGA生存模型的构建以及模型预测和评估[ht...

  • 2018-12-15

    跨界学习,构建多元知识模型 多元知识模型来自于投资大师查理芒格,他强调,世界上的学科在很多方面是相同的,用在预测上...

  • 时间序列模型

    最近做基于时间序列的销量预测模型,整理下思路,分享下。大致分为数据预处理、频谱分析、模型构建并预测、模型整合、结果...

  • 构建预测模型的流程

    1.提取或组合预测所需的特征确定哪些特征可用于预测也需要实验尝试。这个过程就是特征提取和特征工程。特征提取就是一个...

  • example

    预处理 构建模型 保存模型checkpoint 可视化 构建并训练 保存为h5 预测 验证 加载 重新验证

  • 在独立表达量数据集构建和验证机器学习(随机森林)

    记录在TCGA数据集构建机器学习模型预测患者亚型,然后在geo数据集检验。 假如我们在TCGA数据集上构建出亚型,...

  • 最优模型应该是最正确模型

    在构建统计模型分析数据的过程中,选择一个最优模型用于解释变量关系是最理想的结果。在进行模型选择时,通常根据模型预测...

网友评论

    本文标题:22分的预测模型构建文章是一种怎样的水平?(上)

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/sxkzmctx.html