Command blast excluding species

作者: OmicsAcademy | 来源:发表于2019-02-02 04:00 被阅读0次

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Use NCBI's taxonomy browser and link from there to genbank GI list of all nucleotides or proteins. Download that and use it in the command line blast, for example from here to here, then "send to" -> "file" -> "GI list"

Reference
https://www.biostars.org/p/100979/

Command blast excluding species
Use NCBI's taxonomy browser and link from there to genban...
在springboot中排除tomcat，使用其他webserv
excluding tomcat dependencies from springboot in gradle
D89-20170616-词伙-226
the human species E.G. a rare tropical species species of...
[译]不在路由中使用 CSRF 中间件 Laravel 5.1
原文地址: Excluding Routes from the CSRF Middleware Laravel 默...
【R】单细胞分析GO KEGG报错解决方法
Error in download.KEGG.Path(species) : 'species' should b...
本地BLAST使用方法（command line）
Prologue BLAST: Basic Local Alignment Search ToolBLASTn：核...
2015-6-28
5.5 mph for nearly 20 mins, maybe 19 mins excluding warmi...
R语言KEGG通路信息下不下来怎么办
杀杀报错信息：Error in download.KEGG.Path(species): 'species' sh...
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安装BLAST mamba install -c bioconda blast 构建核酸BLAST数据库，这里因为...
基因家族鉴定流程（二）用blast、mmseqs、diamon
本文章将介绍 ①类blast软件blast、mmseqs、diamond、hmmer的比较 ②blast、mmse...