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R语言KEGG通路信息下不下来怎么办

R语言KEGG通路信息下不下来怎么办

作者: 不会生信哟 | 来源:发表于2022-08-21 15:31 被阅读0次

    杀杀
    报错信息:
    Error in download.KEGG.Path(species): 'species' should be one of organisms l

    install.packages('R.utils')
    R.utils::setOption("clusterProfiler.download.method",'auto')
    

    再运行KEGG代码

    path <- enrichKEGG(
      gene          = degene,
      #keyType     = "SYMBOL",
      organism   = 'hsa',
      pvalueCutoff      = 0.05,
      pAdjustMethod     = "BH",
      qvalueCutoff  = 1
    )
    

    引自:
    https://www.biowolf.cn/Question/kegg_error.html

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