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如何从UCSC获取感兴趣区域的BED文件

如何从UCSC获取感兴趣区域的BED文件

作者: 不想透明的小透明 | 来源:发表于2019-02-12 17:25 被阅读256次

    2019-02-12

    1. 首先进入UCSC的Table Browser:https://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTables

    2. 按照下图例子进行参数设置

    UCSC Table Browser提取BED文件举例

    Tips: 将output format改选为“BED-browser extensible data”, output file一定要填写,如果空着的话即使选择了output format为BED格式也是输出网页形式; file type returned我一般都选择gzip compressed,下载相对快一些。

    3. 点击Get output

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