Redundans管道协助杂合基因组的组装。程序将输入 组装的重叠群,测序文库和/或参考序列作为输入,并返回支架纯合基因组组装。最终装配应该较少碎片,总尺寸小于输入重叠群。此外,Redundans将自动缩小基因组装配或脚手架产生的间隙。
安装安装说明安装
git clone --recursive https://github.com/lpryszcz/redundans.git
cd redundans && bin/.compile.sh
会报错,
[train@train biosoft]$ cd redundans && bin/.compile.sh
-bash: bin/.compile.sh: Permission denied
在bin/ 查看可知,“.compole.sh”是隐藏文件,怎么办呢?
更改文件夹权限即可
chmod -R 777 redundans/
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