背景介绍
古生生物普遍存在，在地球生物圈的元素循环中起着重要作用；但人们对它们在喀斯特环境中的多样性、分布、丰度和对喀斯溶环境的影响知之甚少。本研究探讨了环境因素对中国南方最大的喀斯特湿地--桂林会仙喀斯特湿地公园沉积物中古菌群落变化的影响。
研究思路
主要结果
1、环境中古菌的丰度：从48个夏季和冬季样本中，共估计了2510个相似性为97%的OTUs。古细菌群落的覆盖率为48~82%。对于同一季节的样本，4个采样点之间或不同深度间隔之间的alpha多样性指数没有显著差异。
2 、每个沉积物样本中主要的古菌群：4个研究地点的古菌群落主要包括两个优势门，广古菌门 Euryarchaeota（57.4%)和深古菌门Bathyarchaeota(38.7%）。广古菌门由5种产甲烷古菌组成，深古菌门中MCG-11, MCG-6和MCG-5b为优势种,根据三代测序的结果，在下表列出了指标物种。
3、影响古菌群落的环境因素：在本研究中将每个样品的pH、含水率、温度、溶解钙离子、硝酸盐和硫酸盐浓度作为物理化学指标进行分析。在冬季，古菌的丰度和多样性都高于其他喀斯特系统和湿地，但在夏季则呈相反的趋势。沉积物中的硝酸盐浓度可能是影响古菌丰度和多样性的因素，而含水量和pH值是影响古菌群落空间变化最大的因素。此外，喀斯特环境的钙丰富度、供水和弱碱化的共同特征可能有利于深海古菌亚群MCG-11, MCG-6和MCG-5b的丰度。对产甲烷菌的鉴定表明，古菌可能对碳循环有很大的贡献。
文章链接：《Frontiers in Microbiology》
https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.675665
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