python 软件安装

附： Perl 软件问题一般会回归到模块问题。

• pip install deeptools : 用pip 安装deeptools软件。（也可用conda安装）
  pip install --index-url +网址deeptools （使用pip 换镜像安装）
  pipy国内镜像有：豆瓣、华中理工大学 、山东理工大学、中国科学技术大学。

deepTools（一套工具）解决了处理大量数据的挑战，这些数据现在通常由DNA测序中心生成。deepTools包含有用的模块，用于处理映射读取数据以进行多种质量检查，以标准bedGraph和bigWig文件格式创建标准化覆盖文件，允许在不同文件之间进行比较（例如，处理和控制）。最后，使用这样的标准化和标准化文件，deepTools可以创建许多可用于发布的可视化，以识别基因组的富集和功能注释。

• export ：用来设置、查看或删除Shell的环境变量。
  export 可选参数 环境变量 变量值
  -f ：代表环境变量为函数名称
  -n： 删除指定的环境变量
  -p : 列出所有的环境变量

• pip install --index-url +镜像网址 HTSeq

• pip install --index-url +镜像网址 cnvkit

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