目前最全的R语言-图片的组合与拼接

作者: 26f5ec553f1c | 来源:发表于2019-01-16 10:35 被阅读852次

1 customLayout包

参考来源：

https://www.rdocumentation.org/packages/customLayout/versions/0.2.0
https://mp.weixin.qq.com/s/zbp8pOQcNB4XBBF5SCg5GA

1.1 简介

customLayout用于拼图特别方便，尤其是仪表盘布局
支持R内置的base绘图对象，ggplot2对象（与grid结合）

Hide

”library(ggplot2)library(customLayout)

1.2 简单画布

通过设置简单的数字矩阵以及对应的宽高比，可以非常方便的设置出来数字拼图
关键函数：

lay_new()创建拼图画布
lay_show() 显示拼图画布

mat数字矩阵必须从1开始，且必须连续

library(ggplot2)library(customLayout)# 创建拼图画布lay1 <- lay_new( 
  mat = matrix(1:4, ncol = 2), # 矩阵分布，mat表示指定排版的数字矩阵 
  widths = c(3,2),             # 设定宽度比例
  heights = c(2,1)             # 设置高度比例)# 显示拼图画布lay_show(lay1) 

# 创建第2个拼图画布，与第1个结构一样，只是比例不一样lay2 <- lay_new(  matrix(1:4, nc = 2), widths = c(3, 5),heights = c(2, 4))lay_show(lay2)

image001.png

1.3 画布合并

其它拼图包没有的功能，非常好用
跟合并矩阵类似。分为行合并和列合并

lay_bind_col()画布列合并 lay_bind_col(x, y, widths = c(1, 1), addmax = TRUE)参数widths表示指定合并宽度比
lay_bind_row()画布行合并 lay_bind_row(x, y, heights = c(1, 1), addmax = TRUE) 参数heights表示指定合并高度比

library(ggplot2)library(customLayout)# 画布列合并cl_1 <- lay_bind_col(lay1, lay2, widths = c(3, 1))  # 指定合并宽度比为3:1lay_show(cl_1)# 画布行合并cl_2 <- lay_bind_row(lay1, lay2, heights = c(3, 1))  # 指定合并高度比为3:1lay_show(cl_2)# 多次合并lay_show(lay_bind_col(cl_1, cl_2, widths = c(2:1)))

image003.png

image005.png

1.4 画布嵌套

这个功能也是其它包没有的，非常有用
关键函数：

lay_split_field(lay, newlay, field)

参数lay表示大画布，参数newlay表示要嵌套进去的小画布，field表示指定要嵌套的区域编号

library(ggplot2)library(customLayout)
slay <- lay_split_field(lay1, lay2, field = 1)  # 将画布lay2嵌套进lay1的第1个区域，即左上角格子lay_show(slay)

library(ggplot2)library(customLayout)
slay2 <- lay_split_field(lay = lay2, new = lay1, field = 4)  # 将画布lay1嵌套进lay2的第4个区域，即右下角格子lay_show(slay2)

image007.png

image009.png

1.5 填充图片

关键函数：

lay_set(layout)将画布layout设置为绘图布局，用于base绘图对象
lay_grid(grobs, lay, ...) 将绘图对象grobs填充到画布lay中，用于ggplot2等绘图对象

1.5.1 基础绘图对象填充

library(ggplot2)library(customLayout)par(mar = c(3, 2, 2, 1)) # 设定页边距# 创建排版画布lay1  <- lay_new(   
  matrix(1:4, nc = 2), # 2行2列布局画布
  widths = c(3, 2),  heights = c(2, 1))
lay2 <- lay_new(matrix(1:3)) # 3行1列布局画布cl <- lay_bind_col(lay1, lay2, widths = c(3, 1)) # 画布列合并lay_show(cl)lay_set(cl) # 设定绘图对象布局 set.seed(123)# 绘图填充plot(1:100 + rnorm(100)) # 填充到画布第1格plot(rnorm(100), type = "l") # 填充到画布第2格hist(rnorm(500))acf(rnorm(100)) # 填充到画布第4格pie(c(3, 4, 6), col = 2:4)pie(c(3, 2, 7), col = 2:4 + 3)pie(c(5, 4, 2), col = 2:4 + 6)

image011.png

image013.jpg

1.5.2 ggplot2绘图对象填充

library(ggplot2)library(customLayout)library(gridExtra)# 创建排版画布lay1 <- lay_new(matrix(1:2, ncol = 1))  # 2行1列画布lay2 <- lay_new(matrix(1:3))  # 3行1列画布cl <- lay_bind_col(lay1, lay2, widths = c(3, 1))  # 画布列合并# 创建数据cuts <- sort(unique(diamonds[["cut"]]), decreasing = TRUE)
make_cut_plot <- function(cut) {
    dd <- diamonds[cut == diamonds[["cut"]], ]  # 
    ggplot(dd) +       geom_point(aes(carat, price)) +      facet_wrap("cut")  # 封装分面}

plots <- lapply(cuts, make_cut_plot)  # 对不同切割水平的进行作图lay_grid(plots, cl)  # 将绘图对象依次填充到cl画布中

image015.jpg

2 cowplot包

cowplot是一个ggplot2包的简单补充，意味着其可以为ggplot2提供出版物级的主题等。
更重要的是，这个包可以组合多个”ggplot2”绘制的图为一个图，并且为每个图加上例如A,B,C等标签，
这在具体的出版物上通常是要求的。语法结构与ggplot类似，将ggplot2图作为一个对象置于ggdraw()中
表达式：

draw_plot(plot, x = 0, y = 0, width = 1, height = 1, scale = 1)
draw_text(text, x = 0.5, y = 0.5, size = 14, hjust = 0.5, vjust = 0.5,...)
draw_plot_label(label, x = 0, y = 1, hjust = -0.5, vjust = 1.5, size = 16, fontface = "bold", family = NULL, colour = NULL, ...)

参数解释：

plot 表示ggplot2绘图对象
x, y 表示子图的起点坐标(左下角坐标)，在0-1之间，表示占母图的比例，
width, height 表示子图长宽所占比例，在0-1之间
text 表示要映射的文本向量
label 表示要映射的文本向量
其它参数与ggplot2中意思一样

library(ggplot2)library(cowplot)library(showtext)font_add_google("Dancing Script", "Dancing")

plot.iris <- ggplot(iris, aes(Sepal.Length, Sepal.Width)) +     geom_point() + facet_grid(cols = vars(Species)) # 按Species列分面plot.mpg <- ggplot(mpg, aes(x = cty, y = hwy, colour = factor(cyl))) +   geom_point(size = 2.5) +    labs(title = "dot plot") 

plot.diamonds <- ggplot(diamonds, aes(clarity, fill = cut)) +   geom_bar() +   theme(axis.text.x = element_text(angle = 70, vjust = 0.5)) +   labs(title = "bar plot")

gg <- ggdraw() +     draw_plot(plot.iris, 0, 0.5, 1, 0.5) + # 在母图上半部，占母图比例1/2  draw_plot(plot.mpg, 0, 0, 0.5, 0.5) + # 在母图左下角，占母图比例1/4  draw_plot(plot.diamonds, 0.5, 0, 0.5, 0.5) + # 在母图右下角，占母图比例1/4 draw_plot_label(c("A", "B", "C"), c(0, 0, 0.5), c(1, 0.5, 0.5), size = 15, colour = "cyan", family = "Dancing") # 加上标签，showtext_begin()print(gg)showtext_end()

image017.jpg

3 grid 包

grid中文翻译为网格，可将其解释为画布分割，通过设定相应的参数，从而可以任意的摆放图形
常用函数：

grid.newpage()创建新的画布
grid.layout()分割画布，使用参数widths和heights指定分割比例 ,从上到下，从左到右排列
viewport()在画布中创建视窗
grid.show.viewport()在画布中展示视窗
grid.show.layout()展示分割的画布
pushViewport()将新建的viewport推出去，即将工作区域切换到新的viewport
popViewport()将当前的viewport删除，其父viewport作为新的工作区域, 子viewport中的绘制的图形不会被删除
downViewport()导航到子viewport，并作为工作区域，原viewport不会删除
upViewport()导航到父viewport，父viewport变为工作区域, 原viewport不会被删除
seekViewport()导航到name参数所在的viewport,并作为工作区域
grid.text() 输出文本标签,坐标只与画布有关，与viewport无关

语法：

viewport(x = unit(0.5, "npc"), y = unit(0.5, "npc"),
         width = unit(1, "npc"), height = unit(1, "npc"),
         default.units = "npc", just = "centre",
         gp = gpar(), clip = "inherit",
         xscale = c(0, 1), yscale = c(0, 1),
         angle = 0,
         layout = NULL,
         layout.pos.row = NULL, layout.pos.col = NULL,
         name = NULL)

grid.layout(nrow = 1, ncol = 1,
        widths = unit(rep_len(1, ncol), "null"),
        heights = unit(rep_len(1, nrow), "null"),
        default.units = "null", respect = FALSE,
        just="centre")

参数解释：

name 指定viewport的名字，用于搜索和定位
x,y 为起点坐标，默认是矩形视窗中心坐标，为0 - 1的数字，表示占newpage的比例
width, height 为矩形视窗的长宽，同样是占newpage的比例
angle 表示角度，从-360到360,正数表示逆时针旋转，负数表示顺时针旋转
just 表示指定视窗起点位置，默认“centre”, 还可以设置左下角c(“left”, “buttom”), 右上角c(“right”, “top”) 等
layout grid.layout对象，用于将当前的viewport拆分为子区域
layout.pos.row 创建的viewport在父节点layout的行位置
layout.pos.col 创建的viewport在父节点的layout列位置
nrow 表示将该区域拆分为几行
ncol 表示将该区域拆分为几列
widths 表示每个子区域的宽度,向量长度等于ncol
heights 表示每个子区域的高度，向量长度等于nrow
gp = gpar() 表示传递其它参数，如: col/fill颜色,lty线型, lwd线宽, fontsize文本尺寸, fontfamily字体, fontface字型等，
可以通过?gpar查询

library(ggplot2)library(grid)grid.newpage()  # 创建一个空白画布vp1 <- viewport(x = 0.5, y = 0.5, width = 0.5, height = 0.25, angle = 45)  # 设定视窗大小grid.show.viewport(vp1)  # 查看在画布中的的视窗，自动上色，方便观察

image019.png

library(ggplot2)library(grid)library(showtext)

YaHei <- windowsFont("微软雅黑")font_add("YaHei", regular = "msyh.ttc", bold = "msyhbd.ttc")  # 右键字体，然后点击属性，regular指定常规, bold表示指定粗体字体 showtext_auto()
#### 父viewportgrid.newpage()  #新建一个pagevp1 <- viewport(x = 0, y = 0.2, w = 0.9, h = 0.8, just = c("left", "bottom"))  #新建一个viewport，起点为左下角，pushViewport(vp1)  # 推出vp1grid.rect(gp = gpar(col = "red"))  # 新建一个矩形,gp=gpar()表示设置图形参数grid.text("我在vp1_1", x = 0.8, y = 0.2, gp = gpar(col = "red", fontfamily = "YaHei", fontsize = 15))  # 新建一个文本,输出到vp1vp2 <- viewport(x = 0, y = 0.2, w = 0.9, h = 0.8, just = c("left", "bottom"))  # 新建一个viewport，起点为左下角，pushViewport(name = vp2)  # 将工作区域设置到vp2grid.rect(x = 0.1, y = 0.2, width = 0.9, height = 0.7, just = c("left", "bottom"), gp = gpar(col = "blue", lty = "dashed"))  # 新建一个矩形,gp=gpar()表示设置图形参数 grid.text("我在vp2_1", x = 0.8, y = 0.3, gp = gpar(col = "blue", fontfamily = "YaHei", fontsize = 15))  # 新建一个文本,输出到vp2vp3 <- viewport(x = 0.1, y = 0.2, width = 0.9, height = 0.7, just = c("left", "bottom"))pushViewport(vp3)grid.rect(x = 0.1, y = 0.2, width = 0.7, height = 0.7, just = c("left", "bottom"), gp = gpar(col = "orange", lty = "twodash", lwd = 2))  # 新建一个矩形,gp=gpar()表示设置图形参数 grid.text("我在vp3_1", x = 0.6, y = 0.4, gp = gpar(col = "orange", fontfamily = "YaHei", fontsize = 15))  # 新建一个文本,输出到vp2

image021.jpg

layout参数

library(ggplot2)library(grid)grid.newpage()
g1 <- grid.layout(nrow = 3, ncol = 2, widths = c(2, 3), heights = c(2, 1, 3))  # 设置分割的宽度和长度比例grid.show.layout(l = g1)

image023.png

综合例子

library(ggplot2)library(grid)library(showtext)

YaHei <- windowsFont("微软雅黑")font_add("YaHei", regular = "msyh.ttc", bold = "msyhbd.ttc")  # 右键字体，然后点击属性，regular指定常规, bold表示指定粗体字体 showtext_auto()

plot.iris <- ggplot(iris, aes(Sepal.Length, Sepal.Width)) + geom_point() + facet_grid(cols = vars(Species))  # 按Species列分面plot.mpg <- ggplot(mpg, aes(x = cty, y = hwy, colour = factor(cyl))) + geom_point(size = 2.5) +       labs(title = "dot plot")

plot.diamonds <- ggplot(diamonds, aes(clarity, fill = cut)) + geom_bar() + theme(axis.text.x = element_text(angle = 70, 
    vjust = 0.5)) + labs(title = "bar plot")grid.newpage()  # 新建画布layout_1 <- grid.layout(nrow = 3, ncol = 2, widths = c(1, 1), heights = c(1,
    4, 5))  # 分成上下2*3共6个版块，最上面版块显示标题pushViewport(viewport(layout = layout_1))  # 推出分成6个版块的视窗print(plot.iris, vp = viewport(layout.pos.row = 2, layout.pos.col = c(1, 2)))  # 在中间一行子视窗中画plot.irisprint(plot.mpg, vp = viewport(layout.pos.row = 3, layout.pos.col = 1))  # 在左下角子视窗中画plot.mpgprint(plot.diamonds, vp = viewport(layout.pos.row = 3, layout.pos.col = 2))  #在右下角子视窗中画plot.diamondsgrid.text("我是画布名称", x = 0.5, y = 0.95, gp = gpar(col = "orange", fontfamily = "YaHei", fontsize = 15))  # 增加画布标题

image025.jpg

3.1 子母图

子母图，主要是形成局部放大的效果，既可以从整体上对比，又兼顾特别小的数据组，或特别密的数据点可以查看，而没有必要单独做2张图

library(ggplot2)library(grid)

3.2 grid 拼接蝴蝶图

library(ggplot2)library(grid)library(dplyr)library(showtext)library(Cairo)
YaHei <-  windowsFont("微软雅黑")font_add("YaHei",regular = "msyh.ttc", bold = "msyhbd.ttc") # 右键字体，然后点击属性，regular指定常规, bold表示指定粗体字体 CairoPNG(file = "E:/R_input&output/images_output/蝴蝶图_exercing.png", width = 1200, height = 700)showtext_begin()#生成图形所需数据集：mydata<-data.frame(id=1:14,A=c(5.0,14.7,2.5,8.5,5.1,6.9,7.7,6.8,4.4,4.9,5.3,1.0,0.9,7.8),B=c(31.3,24.7,17.8,17.2,15.3,14.3,13.9,13.9,12.4,10.0,6.5,4.2,2.5,0.9),Label=c("Website","Customer & Employee Referral","Webinar","Facebook/Twitter/Other Social","Marketting & Advertising","Paid Serch","Other","Sales generated","Tradeshows","Parter","Linkedin","Events","Lead list","Emial Campaign"))

p1<-ggplot(mydata) + # 绘制右侧的柱形图  geom_hline(yintercept=mean(mydata$A),linetype=2,size=.25,colour="grey")+  geom_bar(aes(x=id,y=A),stat="identity",fill="#E2BB1E",colour=NA)+  ylim(-5.5,16)+   scale_x_reverse()+   geom_text(aes(x=id,y=-4,label=Label),vjust=.5)+  geom_text(aes(x=id,y=A+.75,label=paste0(A,"%")),size=4.5,family="YaHei",fontface="bold")+  coord_flip()+  theme_void()
p1

p2<-ggplot(mydata)+ # 绘制左侧柱形图, 左侧图没有横坐标刻度标签  geom_hline(yintercept=-mean(mydata$B),linetype=2,size=.25,colour="grey")+  geom_bar(aes(x=id,y=-B),stat="identity",fill="#C44E4C",colour=NA)+ # y=-B,绘制的图形在另一侧  ylim(-40,0)+  scale_x_reverse()+ #   geom_text(aes(x=id,y=-B-1.75,label=paste0(B,"%")),size=4.5,family="YaHei",fontface="bold")+  coord_flip()+  theme_void()
p2

# 图形拼接grid.newpage() # 新建画布layout_1 <- grid.layout(nrow = 2, ncol = 2, widths = c(2, 3), heights = c(1, 9)) # 分成2*2共4个版块pushViewport(viewport(layout = layout_1)) # 推出分为4个版块的视窗print(p1, vp = viewport(layout.pos.row = 2, layout.pos.col = 2)) # 将p1输出到右下角print(p2, vp = viewport(layout.pos.row = 2, layout.pos.col = 1)) # 将p2输出到左下角# 添加主标题和分标题grid.text(label="我是主标题",x = 0.5,y = 0.97,gp=gpar(col="cyan",fontsize=15,fontfamily="YaHei",draw=TRUE,just = "centre"))grid.text(label="我是左标题", x = 0.15,y =0.94,gp=gpar(col="blue",fontsize=10,fontfamily="YaHei",draw=TRUE,just = c("left", "top")))grid.text(label="我是右标题",x = 0.85,y =0.94,gp=gpar(col="blue",fontsize=10,fontfamily="YaHei",draw=TRUE,just = c("right", "top")))

showtext_end()dev.off()

<pre style="box-sizing: border-box; font-family: Monaco, Menlo, Consolas, "Courier New", monospace; font-size: 13px; white-space: pre-wrap; display: block; padding: 9.5px; margin: 0px 0px 10px; line-height: 1.42857; color: rgb(51, 51, 51); word-break: break-all; overflow-wrap: break-word !important; background-color: white; border: 1px solid rgb(204, 204, 204); border-radius: 4px; max-width: 100%; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; letter-spacing: 0.544px; text-align: justify; widows: 1; overflow: auto;">## png

2</pre>

image027.jpg

蝴蝶图

4 gridExtra包

主要函数：

arrangeGrob()
grid.arrange()
marrangeGrob()

语法：

arrangeGrob(..., grobs = list(...), layout_matrix, vp = NULL,
  name = "arrange", as.table = TRUE, respect = FALSE, clip = "off",
  nrow = NULL, ncol = NULL, widths = NULL, heights = NULL, top = NULL,
  bottom = NULL, left = NULL, right = NULL, padding = unit(0.5, "line"))

grid.arrange(..., newpage = TRUE)

marrangeGrob(grobs, ..., ncol, nrow, layout_matrix = matrix(seq_len(nrow *
  ncol), nrow = nrow, ncol = ncol), top = quote(paste("page", g, "of",
  npages)))

参数解释：

grobs 图形对象列表，grob是graphical object两个单词的缩写，表示ggpot等图形对象
layout_matrix 表示布局的矩阵

library(ggplot2)library(gridExtra)library(showtext)

YaHei <-  windowsFont("微软雅黑")font_add("YaHei",regular = "msyh.ttc", bold = "msyhbd.ttc") # 右键字体，然后点击属性，regular指定常规, bold表示指定粗体字体 showtext.auto()

empty <- ggplot() + geom_point(aes(1, 1), colour = "white") +   theme(axis.ticks = element_blank(), 
        panel.background = element_blank(), 
        axis.line = element_blank(), 
        axis.text.x = element_blank(), axis.text.y = element_blank(), 
        axis.title.x = element_blank(), axis.title.y = element_blank())

scatter <- ggplot() + geom_point(aes(mtcars$mpg, mtcars$qsec)) # 绘制主图散点图hist_top <- ggplot() + geom_histogram(aes(mtcars$mpg)) # 绘制上方频率分布直方图hist_right <- ggplot() + geom_histogram(aes(mtcars$qsec)) + coord_flip() # 绘制右侧频率分布直方图# 最终组合，由4个图拼图而成，只有右上角的图已经将标注移除了grid.arrange(hist_top, empty, scatter, hist_right, # 按从左到右，从上到下顺序排列4个图ncol = 2, nrow = 2, widths = c(4, 1), heights = c(1, 4)) # 4个版块的长宽比例# 其实这种组合图已经有相应的R包了，ggExtra# df <- data.frame(x = mtcars$mpg, y = mtcars$qsec)# p <- ggplot(df, aes(x, y)) + geom_point() + theme_classic()# ggExtra::ggMarginal(p, type = "histogram")

image029.jpg

把绘图对象添加到列表总，并把该列表传递给grid.arrange()函数中的grobs参数

library(ggplot2)library(gridExtra)library(lattice)  # 类似ggplot,但是语法更加复杂library(showtext)

YaHei <- windowsFont("微软雅黑")font_add("YaHei", regular = "msyh.ttc", bold = "msyhbd.ttc")  # 右键字体，然后点击属性，regular指定常规, bold表示指定粗体字体 showtext.auto()
gs <- list(NULL)
gs[[1]] <- qplot(1, 1)
gs[[2]] <- xyplot(1 ~ 1)  # lattice包grid.arrange(grobs = gs, ncol = 2)

image031.jpg

子母图
grid包可以画字母图
安装gridExtra包后，ggplot2中多了一个ggplotGrob()函数，可以创建grob对象参数

library(ggplot2)library(gridExtra)
g <- ggplotGrob(qplot(1, 1) +                               theme(plot.background = element_rect(colour = "black")))qplot(1:10, 1:10) +    annotation_custom(      # 通过添加注释的方式，向图形内部添加一个图形
    grob = g,  # 插入图形对象，即添加内容
    xmin = 1, xmax = 5, ymin = 5, ymax = 10 # 添加位置4个坐标
  )

image033.jpg

来源：EasyCharts

目前最全的R语言-图片的组合与拼接

1 customLayout包

1.1 简介

1.2 简单画布

1.3 画布合并

1.4 画布嵌套

1.5 填充图片

1.5.1 基础绘图对象填充

1.5.2 ggplot2绘图对象填充

2 cowplot包

3 grid 包

3.1 子母图

3.2 grid 拼接蝴蝶图

2</pre>

4 gridExtra包

相关文章

网友评论

延伸阅读

深度阅读

栏目导航

热点阅读

R语言可视化

R语言

R生信相关