概况:使用处理后的fastq文件和基因组与转录组比对,确定在转录组或者基因组中的关系。在转录组和基因组的比对采取的...
流程概览 转录组测序的分析流程大致可以分成三类,包括基因组比对(Genome mapping)、转录组比对(Tra...
学习资料:B站视频:生物技能树 第八季转录组测序数据分析 一、转录组比对常用软件 转录组比对常用:hisat2、s...
问题的描述 RSEM 是典型的基于转录本定量的方法,它的比对需要下载参考转录本的fa序列,与基因组比对不同,转录本...
今天进行序列比对课程的学习 序列比对 1. 无参转录组 1.1 使用拼接工具组装转录本trinity 1.2 tr...
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参考:转录组分析记录; 转录组入门和进阶以下内容为转录组全部的上游分析,包括下载数据、比对、计数得到表达矩阵。ht...
我们常见的转录组表达分析一般都是将reads比对至参考基因组或者转录组上,然后在基因或者转录本水平上定量表达丰度。...
本文标题:2022-10-14 转录组比对
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