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利用R语言将罗氏Roche定量仪导出的txt数据转化为csv文件

利用R语言将罗氏Roche定量仪导出的txt数据转化为csv文件

作者: 佳名 | 来源:发表于2021-11-10 10:42 被阅读0次

Roche定量仪配套软件LightCycler@96只能将定量结果导出为txt文件,而txt文件复制数据并不方便。如按列复制时,就只能挨个复制。

Roche qPCR.png
于是利用R语言的遍历函数将txt文件转为csv文件,此时的csv文件就可以用office excel打开了。
myfiles <- list.files(pattern = "*.txt")
myfiles
for (i in myfiles){
  matrix<-read.csv(i,sep="\t",header=T,check.names = F)
  title=paste0(i,".csv")
  #print(title)
  write.csv(matrix,title,row.names = T)
  }

使用方法:将配套软件导出的文件放在同一个目录下,该目录不含有其他txt文件,然后在该目录新建R脚本,运行上述命令。

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