zcat chicken223.sv.vcf.gz | awk -v OFS="\t" '/^#/|| $3=$1"_"$2{print $0}' >finally.vcf
vcftools是用来处理vcf和bcf文件的工具集,功能涵盖了过滤,数据格式转换,一些指标的统计计算,vcf文件...
偶然见发现了一R包,名曰vcfR,可高效处理vcf文件,并且可以做出好看的图片 具体可查看说明文档高铁直达 安装 ...
BCFtools可用于处理VCF和BCF文件;具体可参考BCFtools说明文档[http://samtools....
(自己)常用的文本文件的行处理命令 示例文件:test.vcf1、head -n 10 test.vcfhead ...
BedTools 笔记 工具目的:探索、处理和操作基因间隔文件(e.g., BED, VCF, BAM)。 学习T...
拿到 raw vcf 文件
地址:文件替换/删除工具 该工程主要功能为:文件重命名、文件内容替换以及文件删除功能 配置介绍 选择所需处理的文件...
作为表格文本处理命令awk的延伸,Heng Li开发了专门处理生物信息学的文件(例如bed, sam, vcf, ...
目标 通过varscan等找到somatic mutations之后,想看多个样本的突变之间的交集。bcftool...
本文标题:处理vcf文件之替换snpID
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/tirzxdtx.html
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