CPC2的下载及使用

• 先下载软件压缩包到桌面，地址（http://cpc2.gao-lab.org/data/CPC2-beta.tar.gz）
• 安装

 tar xzvf CPC2-beta.tar.gz
 cd CPC2-beta/
 ls
 pwd
 export CPC_HOME="/public/jychu/soft/CPC2-beta"
 cd libs/libsvm
 tar xzvf libsvm-3.18.tar.gz
 cd libsvm-3.18
 ls
 make clean && make

• 使用

conda activate python2  #cpc2脚本只能在python2环境下使用
cd /public/jychu/lncRNA-goose/cleandata/bam/gtfs/merged/Identification
mkdir lncRNA
python /public/jychu/soft/CPC2-beta/bin/CPC2.py -i iux200LFPKM0.1.fa -o lncRNA/goose.cpc2      #运行命令