现有的参考基因组存储网站三个：

ENSEMBL
UCSC
NCBI

• UCSC 的命名是hg/mm系列，之前最常用的就是hg19参考基因组了。
• ENSEMBL的命名规则则是采用GRCh/m的方式，GRCh37对应hg19，hg38对应GRCh38。
• NCBI的命名是NP_/NM_等

1.Ensembl数据库

• 物种参考基因组下载网址：ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-99/fasta/homo_sapiens/(人类为例)

2.RefSeq数据库(NCBI)

箭头分别选择Genome和输入物种的拉丁学名

image.png

按箭头下载文件（下载氨基酸序列就可以，protein）

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3.UCSC网站

http://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg38/bigZips/hg38.fa.gz

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4.Gencode数据库

最权威的人类和小鼠基因组的注释还属Gencode数据库：https://www.gencodegenes.org/
进入官网后直接下载对应hg19的最新人类的基因组注释文件 Data-----Human-----GRCh37-mapped Releases