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代谢基因01:代谢相关基因+肝癌(4.8分)

代谢基因01:代谢相关基因+肝癌(4.8分)

作者: 高大石头 | 来源:发表于2021-01-03 23:01 被阅读0次

    代谢基因01:代谢相关基因+肝癌(4.8分)

    文献信息

    整体思路

    亮点:

    • 根据594个代谢相关基因分为3类,不同cluster的差异基因,并构建模型
    • 验证集用best seperation(KM)展示(Figure9&S7)

    结果:

    1.根据594个能量代谢相关基因表达,NMF法可将TCGA-HCC(342),分为3个不同亚型。

    2. 三个亚型间共有576个差异基因+富集分析

    3.576个差异基因→Lasso/Cox→6个基因

    (ANLN,ENTPD2,TRIP13,PLAC8,G6PD,ADH1C)构建预后模型.

    4.44个HCC病人qRT-PCR+IHC验证。

    5.内部+GEO数据集(GSE76427,GSE15654,GSE14520)验证。

    6.Nomogram

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    参考文献:

    Identification of Energy Metabolism Genes for the Prediction of Survival in Hepatocellular Carcinoma

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