代谢基因01:代谢相关基因+肝癌(4.8分)
文献信息整体思路
亮点:
- 根据594个代谢相关基因分为3类,不同cluster的差异基因,并构建模型;
- 验证集用best seperation(KM)展示(Figure9&S7)
结果:
1.根据594个能量代谢相关基因表达,NMF法可将TCGA-HCC(342),分为3个不同亚型。
2. 三个亚型间共有576个差异基因+富集分析
3.576个差异基因→Lasso/Cox→6个基因
(ANLN,ENTPD2,TRIP13,PLAC8,G6PD,ADH1C)构建预后模型.
4.44个HCC病人qRT-PCR+IHC验证。
5.内部+GEO数据集(GSE76427,GSE15654,GSE14520)验证。
6.Nomogram
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参考文献:
Identification of Energy Metabolism Genes for the Prediction of Survival in Hepatocellular Carcinoma
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